More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3966 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 111 aa  226  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  58.93 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  50.89 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  50.44 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  50 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  46.36 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5169  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  46.79 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0108263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  32.73 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  33.93 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  31.53 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  31.53 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  30 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  34.23 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  34.23 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 184 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  30 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  30 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  30 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  26.36 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  31.82 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0271  single-stranded binding protein  33.04 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>