More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5233 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  49.55 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  47.75 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  46.36 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5169  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  36.94 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0108263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.82 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.82 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  31.25 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  32.74 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  34.51 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  33.63 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  33.63 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 186 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  30.36 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  30.09 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  30.09 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  30.09 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  31.13 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  30.19 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  30.97 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  30.97 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  30.97 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  30.48 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  30.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  31.53 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  31.53 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  29.2 
 
 		 190 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>