More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2038 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  100 
 
 		 161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  58.38 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  57.89 
 
 		 160 aa  180  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  55.62 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  72.17 
 
 		 164 aa  177  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  57.83 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  58.58 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  54.17 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  69.23 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  70.43 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  70.43 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2200  single-strand binding protein  70.43 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338329  normal  0.513026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  55.29 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  53.76 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  55.83 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  68.7 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  64.8 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  51.14 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  53.09 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  61.86 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  51.98 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  50.9 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  64.91 
 
 		 169 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  68.42 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  63.16 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  45.76 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  61.74 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  59.84 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  53.42 
 
 		 151 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  62.61 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  62.61 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  62.61 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  61.4 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  61.4 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48.17 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  60.87 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  63.16 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  46.54 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  60 
 
 		 180 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3622  single-strand binding protein  64.1 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0622849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  67.31 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  61.4 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  44.62 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.95 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  45.2 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  60 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  59.13 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  59.38 
 
 		 163 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  61.26 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  51.05 
 
 		 188 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  44.31 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  52.8 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  57.39 
 
 		 233 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  52.8 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  61.82 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  61.82 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  60.36 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  61.82 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  61.82 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  61.82 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  46.47 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  51.02 
 
 		 200 aa  140  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 236 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 234 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  66 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 234 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  48.41 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 234 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 201 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  46.11 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  58.93 
 
 		 231 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 236 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  47.2 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  43.1 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  61.54 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  43.26 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  65 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  47.65 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 234 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  45.68 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  46.91 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  51.41 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  41.36 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  56.88 
 
 		 236 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>