More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1816 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  100 
 
 		 132 aa  269  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  78.05 
 
 		 162 aa  203  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  77.97 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  79.82 
 
 		 173 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  79.82 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  76.67 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  74.36 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  74.79 
 
 		 159 aa  191  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  73.33 
 
 		 170 aa  185  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  74.78 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  72.41 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2200  single-strand binding protein  74.78 
 
 		 183 aa  183  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338329  normal  0.513026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  72.17 
 
 		 189 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  72.17 
 
 		 189 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  71.3 
 
 		 195 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  71.05 
 
 		 176 aa  177  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  70.69 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  71.3 
 
 		 186 aa  176  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  66.1 
 
 		 168 aa  176  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  67.8 
 
 		 164 aa  176  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  66.1 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  68.1 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  70.25 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  68.7 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  61.9 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  61.72 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  70.18 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  63.93 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  70.43 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  67.83 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3622  single-strand binding protein  67.83 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0622849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  63.25 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  62.9 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  64.04 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  64.91 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  64.35 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  66.09 
 
 		 184 aa  159  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  59.84 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  63.16 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 		 170 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  64.91 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  64.04 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  60.87 
 
 		 169 aa  157  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  63.16 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  60.87 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  60.87 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  56.14 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  54.92 
 
 		 177 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  52.76 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  58.26 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  67.35 
 
 		 230 aa  144  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  59.66 
 
 		 201 aa  144  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  57.98 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  58.41 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  61.95 
 
 		 160 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  54.92 
 
 		 222 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  57.63 
 
 		 213 aa  142  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  55.45 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  59.82 
 
 		 219 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  60.87 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0266  single-strand binding protein  49.61 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  53.51 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  64 
 
 		 180 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  57.27 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  59.83 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  56.45 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 		 183 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  53.54 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  59.13 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  59.13 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  54.33 
 
 		 165 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  54.33 
 
 		 165 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  63 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  54.55 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  63 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  63 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  56.3 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  56.45 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  58.12 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  62 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  58.12 
 
 		 183 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  57.26 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  53.72 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  53.39 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  54.7 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  54.1 
 
 		 222 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  60.71 
 
 		 172 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  54.4 
 
 		 174 aa  133  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  57.27 
 
 		 176 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>