More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6613 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 158 aa  331  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  63.86 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  63.19 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  59.88 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  57.49 
 
 		 167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  56.8 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  71.93 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  55.62 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  54.12 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  67.54 
 
 		 169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  54.44 
 
 		 168 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  51.76 
 
 		 170 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  51.83 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  46.91 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  48.26 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  50 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  47.65 
 
 		 168 aa  153  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  58.97 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  42.37 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  50 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  43.39 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  43.39 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  45.06 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  59.65 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2200  single-strand binding protein  57.89 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338329  normal  0.513026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  47.88 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  48.21 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  43.95 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  55.08 
 
 		 145 aa  147  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  43.89 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  57.02 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  54.7 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  56.14 
 
 		 174 aa  143  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  46.76 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0266  single-strand binding protein  47.83 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  48.21 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  42.41 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  54.62 
 
 		 178 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  46.84 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  42.51 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  53.51 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  52.63 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  52.63 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  53.51 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  53.39 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  53.45 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  44.24 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  42.14 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  53.51 
 
 		 173 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  54.87 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  42.14 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  51.28 
 
 		 132 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  42.58 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  56.31 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  57.28 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  57.28 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  58.25 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  58.25 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  58.25 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  50 
 
 		 233 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  57.28 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  40.96 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  39.75 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  50 
 
 		 183 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  51.69 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  51.69 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  41.98 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  39.89 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  56.31 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  50.88 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  56.44 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  38.97 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  56.44 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  56.44 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  56.44 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  42.77 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  56.44 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  40 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.51 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  41.94 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  54.37 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  40 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>