More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3832 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  54.14 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  52.63 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  49.64 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  46.27 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  50.45 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  50.45 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  42.34 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  40.27 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  40 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  38.36 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  38.36 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  43.24 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  49.09 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  49.09 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  40.27 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  46.36 
 
 		 167 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 196 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.16 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.1 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 200 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  41.1 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 236 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 234 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  42.62 
 
 		 222 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 235 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  47.66 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 238 aa  86.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  47.66 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 236 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 		 180 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0266  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  39.74 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  41.59 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40.8 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.36 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.36 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 184 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 183 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 184 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  49.04 
 
 		 181 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 180 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  39.85 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 182 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 186 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>