More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2190 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  100 
 
 		 129 aa  267  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  96.9 
 
 		 140 aa  259  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  56.2 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  56.67 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  53.73 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  47.73 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  58.93 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  49.62 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  48.48 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  49.55 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  40.32 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  39.84 
 
 		 180 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  36.51 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  35.94 
 
 		 176 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 186 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 236 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.33 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 236 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  37.72 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  39.66 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  39.53 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.33 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.61 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 181 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 230 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  40.71 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.96 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  36.94 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  32.8 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  34.96 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  35.94 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  36.51 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5169  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  41.82 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0108263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  33.6 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  39.52 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  38.58 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  38.17 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  34.23 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  34.23 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  37.7 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  35.2 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  32.79 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  32.8 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  30 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>