More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1715 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1715  ABC transporter-like protein  100 
 
 
547 aa  1027    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0193  ABC transporter related  43.04 
 
 
629 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.639764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  35.49 
 
 
550 aa  243  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29 
 
 
575 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  28.65 
 
 
575 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0272  ABC transporter related  31.18 
 
 
578 aa  217  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.933843  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1465  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.7 
 
 
557 aa  200  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  27.02 
 
 
611 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  34.27 
 
 
552 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2302  ABC transporter related protein  25.85 
 
 
582 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.43 
 
 
574 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0944  ABC transporter, transmembrane region, type 1  38.06 
 
 
1081 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  28.75 
 
 
1205 aa  187  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  29.38 
 
 
608 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0823  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.92 
 
 
558 aa  180  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  29.26 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  36.73 
 
 
571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0767  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  34.15 
 
 
559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.54 
 
 
553 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.31 
 
 
580 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  37.28 
 
 
562 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.08 
 
 
589 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3278  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.8 
 
 
579 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  31.65 
 
 
588 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  28.1 
 
 
579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
581 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.28 
 
 
585 aa  166  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.28 
 
 
577 aa  166  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  26.88 
 
 
579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1945  transport ATP-binding protein CydC  27.25 
 
 
573 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  37.47 
 
 
993 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1010  multidrug ABC transporter ATPase/permease  28.5 
 
 
1353 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  27.48 
 
 
578 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  28.12 
 
 
575 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2559  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.96 
 
 
606 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3383  transport ATP-binding protein CydC  27.25 
 
 
573 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.813742  hitchhiker  0.00000000000619034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1811  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  27.19 
 
 
573 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.404009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1762  ABC transporter, ATP-binding and permease  27.68 
 
 
571 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.951203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1980  transport ATP-binding protein CydC  27.68 
 
 
571 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11013e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2023  transport ATP-binding protein CydC  27.43 
 
 
571 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.94731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1779  ABC transporter, ATP-binding and permease  27.21 
 
 
571 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  33.78 
 
 
589 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2418  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.2 
 
 
579 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0870797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1805  transport ATP-binding protein CydC  27 
 
 
571 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2711  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  34.29 
 
 
581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0138021  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1945  transport ATP-binding protein CydC  27 
 
 
571 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2044  transport ATP-binding protein CydC  27.43 
 
 
571 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  31.03 
 
 
652 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.97 
 
 
579 aa  153  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  38.46 
 
 
1522 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0197  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.26 
 
 
595 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3768  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.84 
 
 
573 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000524247  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1215  transport ATP-binding protein CydD  31.18 
 
 
573 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00367068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  32.78 
 
 
719 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  33.47 
 
 
1179 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.93 
 
 
627 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2634  ABC transporter-related protein  32.07 
 
 
572 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159287  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  30.92 
 
 
593 aa  150  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
604 aa  150  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0195026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  34.51 
 
 
571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.28 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  28.88 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  44.84 
 
 
613 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.36 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.32 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  32.28 
 
 
631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2097  ABC transporter related  29.71 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.58 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1370  ABC transporter related  33.22 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  33.77 
 
 
719 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.52 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.16 
 
 
1201 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.98 
 
 
597 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.99 
 
 
634 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  31.07 
 
 
601 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0507  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.47 
 
 
561 aa  147  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.24 
 
 
606 aa  147  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1637  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.11 
 
 
589 aa  147  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.490977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1740  ABC transporter, ATP-binding protein CydD  25.49 
 
 
572 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33 
 
 
632 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.68 
 
 
1257 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.6 
 
 
598 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.4 
 
 
590 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
1218 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  28.69 
 
 
569 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  32.07 
 
 
606 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.06 
 
 
1284 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00093  MdlB protein  27.88 
 
 
563 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.08 
 
 
592 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
574 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
574 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
600 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  40.95 
 
 
609 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  31.44 
 
 
566 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1405  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
648 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  40.67 
 
 
580 aa  143  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  27.73 
 
 
811 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  43.75 
 
 
589 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.03 
 
 
553 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>