More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0371 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  98.01 
 
 		 590 aa  1100    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  97.83 
 
 		 590 aa  1098    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.91 
 
 		 589 aa  859    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  98.37 
 
 		 590 aa  1105    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.22 
 
 		 590 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  98.19 
 
 		 590 aa  1103    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.22 
 
 		 590 aa  985    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.22 
 
 		 590 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.41 
 
 		 588 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.41 
 
 		 588 aa  828    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  98.01 
 
 		 590 aa  1100    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.04 
 
 		 590 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.76 
 
 		 591 aa  867    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.91 
 
 		 588 aa  863    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  97.1 
 
 		 590 aa  1089    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 		 553 aa  1133    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.77 
 
 		 588 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.04 
 
 		 590 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  73.42 
 
 		 588 aa  821    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  98.19 
 
 		 590 aa  1103    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  71.79 
 
 		 607 aa  801    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  98.19 
 
 		 590 aa  1103    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.22 
 
 		 590 aa  985    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  52.36 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  52.17 
 
 		 579 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  50 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  50.28 
 
 		 579 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 		 583 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.38 
 
 		 583 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  46.2 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  46.2 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  46.2 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.2 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.01 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.01 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  45.45 
 
 		 583 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.75 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.75 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  47.08 
 
 		 595 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  42.62 
 
 		 586 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  40.98 
 
 		 586 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.98 
 
 		 586 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.17 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.96 
 
 		 581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  40.98 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.79 
 
 		 586 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.46 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  41.28 
 
 		 586 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.28 
 
 		 586 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.91 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.67 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.65 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.52 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  39 
 
 		 582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  40 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.6 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  35.92 
 
 		 589 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  38.28 
 
 		 598 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.94 
 
 		 577 aa  353  5e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  34.68 
 
 		 585 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  32.67 
 
 		 592 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.76 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  32.75 
 
 		 618 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  34.16 
 
 		 573 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.78 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  37.37 
 
 		 591 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  32.79 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  31.32 
 
 		 573 aa  316  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  33.08 
 
 		 571 aa  313  4.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  33.83 
 
 		 584 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 		 579 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  35.54 
 
 		 541 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.26 
 
 		 569 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  32.15 
 
 		 593 aa  309  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.48 
 
 		 580 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.22 
 
 		 606 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.81 
 
 		 611 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  32.73 
 
 		 607 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  35.52 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  32.73 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  33.15 
 
 		 593 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  31.85 
 
 		 596 aa  300  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  33.81 
 
 		 600 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  31.25 
 
 		 583 aa  296  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.57 
 
 		 586 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  32.25 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.09 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  32.19 
 
 		 574 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.49 
 
 		 588 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  34.69 
 
 		 594 aa  293  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  33.16 
 
 		 641 aa  293  8e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  32.19 
 
 		 590 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  31.6 
 
 		 583 aa  290  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.02 
 
 		 569 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.83 
 
 		 586 aa  286  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.71 
 
 		 764 aa  286  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  31.16 
 
 		 587 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>