More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1405 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1405  ABC transporter related protein  100 
 
 		 648 aa  1285    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8971  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  39.81 
 
 		 611 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3110  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 581 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  32.72 
 
 		 614 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.89 
 
 		 575 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 575 aa  254  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  32.35 
 
 		 611 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.9 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.48 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4273  ABC transporter related  34.76 
 
 		 625 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  34.88 
 
 		 572 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4333  ABC transporter related  34.56 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.131034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.79 
 
 		 608 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.66 
 
 		 610 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.66 
 
 		 610 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.16 
 
 		 1284 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  31.98 
 
 		 596 aa  247  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  31.79 
 
 		 606 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 614 aa  246  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  33.59 
 
 		 652 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.25 
 
 		 610 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.69 
 
 		 601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.12 
 
 		 575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  28.52 
 
 		 577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  28.35 
 
 		 584 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  31.2 
 
 		 592 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.03 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.03 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.03 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 636 aa  243  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  28.03 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  27.85 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.03 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.37 
 
 		 580 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  31.8 
 
 		 594 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.03 
 
 		 586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.13 
 
 		 586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  29.49 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  34.54 
 
 		 634 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  31.01 
 
 		 1522 aa  240  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  28.31 
 
 		 582 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  33.02 
 
 		 777 aa  240  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.5 
 
 		 579 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  32.84 
 
 		 577 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.16 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  30.41 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  29.13 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.16 
 
 		 586 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  32.49 
 
 		 610 aa  239  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.85 
 
 		 589 aa  238  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  32.53 
 
 		 609 aa  238  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.89 
 
 		 632 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.99 
 
 		 586 aa  238  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.13 
 
 		 610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  33.13 
 
 		 1218 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.52 
 
 		 605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.62 
 
 		 618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.24 
 
 		 582 aa  234  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.63 
 
 		 587 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.5 
 
 		 1257 aa  233  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.17 
 
 		 586 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  28.01 
 
 		 648 aa  233  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  32.71 
 
 		 577 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.14 
 
 		 597 aa  233  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  32.12 
 
 		 596 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  31.93 
 
 		 596 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  31.31 
 
 		 606 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 		 608 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.85 
 
 		 585 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  34.3 
 
 		 618 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  32.63 
 
 		 606 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.45 
 
 		 614 aa  230  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 1332 aa  230  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  33 
 
 		 605 aa  230  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.71 
 
 		 611 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  31 
 
 		 1436 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.54 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  32.4 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 596 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  27.45 
 
 		 581 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.52 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  27.97 
 
 		 601 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.87 
 
 		 671 aa  229  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.64 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.83 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.9 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.38 
 
 		 575 aa  228  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  31.96 
 
 		 606 aa  228  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  30.47 
 
 		 578 aa  228  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  29.42 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  28.87 
 
 		 577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.74 
 
 		 768 aa  227  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  31.26 
 
 		 611 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.23 
 
 		 634 aa  227  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  28.93 
 
 		 627 aa  227  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  30.4 
 
 		 726 aa  226  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  33.47 
 
 		 589 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.42 
 
 		 610 aa  226  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>