More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1634 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1634  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 521 aa  1011    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.412877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 591 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  32.4 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  32.98 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  32.5 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  32.1 
 
 		 560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  33.1 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  35.22 
 
 		 593 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  27.66 
 
 		 495 aa  207  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  32.45 
 
 		 604 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  32.09 
 
 		 579 aa  206  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  33.86 
 
 		 552 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  36.75 
 
 		 532 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 358 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  33.82 
 
 		 577 aa  197  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  37.73 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 		 359 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 366 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.56 
 
 		 359 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 359 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 363 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  39.56 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 362 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  38.65 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  37.63 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 359 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.46 
 
 		 362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  35.41 
 
 		 356 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  33.27 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 358 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 358 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 358 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 362 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 		 361 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.7 
 
 		 361 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 358 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 		 368 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 365 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 359 aa  186  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 362 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 365 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  43.12 
 
 		 339 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 370 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  35.94 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  34.81 
 
 		 355 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  36.51 
 
 		 357 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 367 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 370 aa  183  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 360 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 360 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.15 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 		 388 aa  182  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.45 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  41.73 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  39.52 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 361 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  37.94 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 367 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 370 aa  180  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  38.73 
 
 		 359 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  36.5 
 
 		 368 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  41.75 
 
 		 361 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  36.45 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  36.65 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  37.66 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 		 352 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>