More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0821 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0821  EAL domain-containing protein  100 
 
 
541 aa  1124    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0931  EAL domain-containing protein  48.79 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.363166  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3041  EAL domain-containing protein  48.58 
 
 
518 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0038  hypothetical protein  32.74 
 
 
518 aa  279  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003646  Rtn protein  31.85 
 
 
498 aa  270  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4145  hypothetical protein  30.78 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2398  periplasmic sensor diguanylate phophodiesterase  42.74 
 
 
506 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625554  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  32.26 
 
 
530 aa  173  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  34.67 
 
 
534 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  37.78 
 
 
374 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  37.32 
 
 
504 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  34.17 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  34.15 
 
 
538 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  34.69 
 
 
528 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.8 
 
 
516 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.8 
 
 
516 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  39.17 
 
 
530 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.48 
 
 
516 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.17 
 
 
516 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  36.65 
 
 
529 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  38.75 
 
 
522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  36.03 
 
 
506 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.4 
 
 
532 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.4 
 
 
532 aa  157  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  34.06 
 
 
501 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  34.4 
 
 
532 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  34.4 
 
 
532 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.4 
 
 
532 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  34.4 
 
 
532 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  32.48 
 
 
516 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  37.5 
 
 
542 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  37.98 
 
 
532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  38.28 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  36.12 
 
 
532 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  37.6 
 
 
535 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.09 
 
 
521 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  38.08 
 
 
490 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  37.6 
 
 
535 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1243  diguanylate phosphodiesterase  27.45 
 
 
508 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  34.3 
 
 
500 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  32.71 
 
 
507 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 
521 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1542  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.25 
 
 
1006 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  26.85 
 
 
538 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  32.71 
 
 
521 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  32.71 
 
 
507 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.09 
 
 
521 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  36.26 
 
 
521 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  31.47 
 
 
532 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.85 
 
 
486 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0331  EAL domain-containing protein  35.18 
 
 
509 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1343  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.77 
 
 
859 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0844288  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  28.24 
 
 
515 aa  151  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.07 
 
 
739 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  35.38 
 
 
528 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  35.74 
 
 
532 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0568  diguanylate cyclase  34.8 
 
 
586 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  37.22 
 
 
537 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2846  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.46 
 
 
1043 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.698632  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2717  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.21 
 
 
720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.8 
 
 
862 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.51 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3230  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.57 
 
 
851 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  33.33 
 
 
1093 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.51 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  36.51 
 
 
533 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  38.4 
 
 
514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.25 
 
 
704 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 
528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  36.51 
 
 
460 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.8 
 
 
474 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
891 aa  147  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.96 
 
 
965 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  33.85 
 
 
538 aa  146  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  34.62 
 
 
528 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  33.07 
 
 
925 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.94 
 
 
1514 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  32.03 
 
 
519 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  30.57 
 
 
512 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.94 
 
 
1514 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.91 
 
 
362 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  34.29 
 
 
506 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.2 
 
 
890 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.33 
 
 
947 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.26 
 
 
584 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  36.25 
 
 
1534 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.89 
 
 
743 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.2 
 
 
1036 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.46 
 
 
718 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.21 
 
 
1047 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.591711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3098  diguanylate phosphodiesterase  34.62 
 
 
453 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.905617  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  34.98 
 
 
525 aa  144  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.6 
 
 
1036 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.21 
 
 
1047 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0122  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.98 
 
 
515 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907666  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0532  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  34.25 
 
 
715 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  34.29 
 
 
506 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.44 
 
 
735 aa  143  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.9 
 
 
1169 aa  143  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  34.29 
 
 
506 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>