More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0376 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  100 
 
 
516 aa  1058    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  98.84 
 
 
516 aa  1047    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  98.64 
 
 
516 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  98.84 
 
 
516 aa  1048    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  98.84 
 
 
516 aa  1046    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.02 
 
 
504 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  37.34 
 
 
534 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  36.99 
 
 
535 aa  355  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  34.07 
 
 
526 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  31.7 
 
 
528 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  32.83 
 
 
506 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 
506 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  32.83 
 
 
506 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  31.95 
 
 
532 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  31.46 
 
 
518 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  32.83 
 
 
519 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  30.68 
 
 
518 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  32.64 
 
 
538 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  31.26 
 
 
518 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  31.07 
 
 
518 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  40.15 
 
 
526 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  40.15 
 
 
526 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  30.44 
 
 
518 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  38.68 
 
 
530 aa  203  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  43.25 
 
 
514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  41.33 
 
 
518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  32.31 
 
 
518 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  32.31 
 
 
518 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  32.31 
 
 
518 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  32.31 
 
 
518 aa  200  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  32.31 
 
 
518 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  32.31 
 
 
518 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  32.31 
 
 
518 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  32.13 
 
 
515 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  32.09 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  27.43 
 
 
507 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  27.43 
 
 
507 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  27.43 
 
 
521 aa  196  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.43 
 
 
521 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 
500 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  27.43 
 
 
521 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  32.68 
 
 
521 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  31.32 
 
 
511 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.22 
 
 
521 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  30.94 
 
 
506 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  30.7 
 
 
532 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  30.7 
 
 
532 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  30.7 
 
 
532 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.02 
 
 
1262 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.7 
 
 
532 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.48 
 
 
532 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  41.2 
 
 
518 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.63 
 
 
532 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  28.91 
 
 
512 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  26.82 
 
 
486 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  31.12 
 
 
523 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  36.7 
 
 
538 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  41.09 
 
 
528 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  28.51 
 
 
501 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  41.47 
 
 
528 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  37.25 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  38.19 
 
 
794 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.79 
 
 
533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1682  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.82 
 
 
958 aa  183  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.532324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.94 
 
 
474 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.57 
 
 
533 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  41.09 
 
 
528 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.57 
 
 
533 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  39.69 
 
 
528 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  39.93 
 
 
374 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.94 
 
 
460 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6207  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.27 
 
 
1117 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238259  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.65 
 
 
665 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.76 
 
 
1494 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.37 
 
 
1497 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0142  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.69 
 
 
539 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  36.21 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.76 
 
 
1466 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.93 
 
 
516 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.82 
 
 
862 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.27 
 
 
516 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0492  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.51 
 
 
754 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0488  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.4 
 
 
685 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.44 
 
 
533 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  33.02 
 
 
522 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3143  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.69 
 
 
608 aa  179  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.322053  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  36.55 
 
 
1534 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4216  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  38.27 
 
 
1215 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.37 
 
 
1497 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.12 
 
 
533 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.58 
 
 
858 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.37 
 
 
1497 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.996532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2945  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.11 
 
 
778 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.37 
 
 
1487 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.44 
 
 
533 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.61 
 
 
1484 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.978359  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.93 
 
 
516 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  38.27 
 
 
1215 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  39.77 
 
 
537 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>