More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  92.75 
 
 		 521 aa  916    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1054    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  56.78 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  53.83 
 
 		 528 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  57.4 
 
 		 520 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  52.46 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  52.06 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  53.05 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  40.73 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  35.53 
 
 		 501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  34.46 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.34 
 
 		 521 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  34.14 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  34.36 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  34.34 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  34.36 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.14 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.46 
 
 		 486 aa  256  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  31.82 
 
 		 518 aa  250  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  31.82 
 
 		 518 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  31.82 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  31.82 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  31.82 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  31.82 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  33.76 
 
 		 497 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  31.63 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  31.63 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  32.25 
 
 		 528 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  35.37 
 
 		 518 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  33.46 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.22 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  33.71 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  33.71 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.71 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  33.71 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  33.06 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.46 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  30.93 
 
 		 506 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  32.52 
 
 		 518 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  32.07 
 
 		 526 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.27 
 
 		 533 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.27 
 
 		 533 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  32.75 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  32.68 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  30.93 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  32.74 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  30.93 
 
 		 506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  32.75 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  31.4 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.4 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35 
 
 		 474 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  30.71 
 
 		 506 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  30.96 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  31.62 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.54 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  30.6 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  30.6 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  30.24 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  34.1 
 
 		 519 aa  216  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  45.56 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 362 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 362 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  45.17 
 
 		 362 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  45.17 
 
 		 362 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  45.17 
 
 		 362 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  45.17 
 
 		 362 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  35.82 
 
 		 525 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5670  diguanylate phosphodiesterase  31.6 
 
 		 529 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.61 
 
 		 1494 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.61 
 
 		 1466 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3380  GGDEF domain-containing protein  40.15 
 
 		 1479 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0427  sensory box protein  39.56 
 
 		 1491 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.23 
 
 		 1487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  41.46 
 
 		 687 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.88 
 
 		 504 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0422  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.5 
 
 		 1492 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.144881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.2 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.15 
 
 		 1497 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.15 
 
 		 1490 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982948  hitchhiker  0.0000000550616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.15 
 
 		 1497 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.15 
 
 		 1497 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.996532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.06 
 
 		 685 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5086  diguanylate phosphodiesterase  30.56 
 
 		 546 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.2 
 
 		 516 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  30.18 
 
 		 489 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  41.5 
 
 		 685 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  42.58 
 
 		 685 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  31.54 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.74 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  40.56 
 
 		 1534 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.74 
 
 		 516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.75 
 
 		 1485 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  30.47 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  30.51 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>