More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1286 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1048    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  92.75 
 
 		 523 aa  931    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  58.15 
 
 		 511 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  58.33 
 
 		 520 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  53.62 
 
 		 528 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  52.64 
 
 		 528 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  52.45 
 
 		 528 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  52.84 
 
 		 528 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  41.75 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  35.37 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  34.33 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.13 
 
 		 521 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  34.28 
 
 		 507 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  34.28 
 
 		 507 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  34.13 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.93 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  33.94 
 
 		 521 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.39 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 512 aa  258  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  31.98 
 
 		 518 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  31.98 
 
 		 518 aa  250  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  31.98 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  31.98 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  31.98 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  31.98 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  34.07 
 
 		 497 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  31.79 
 
 		 518 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  31.79 
 
 		 518 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  34.18 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  33.9 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.17 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  32.16 
 
 		 518 aa  240  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  32.82 
 
 		 518 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  32.82 
 
 		 518 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  33.63 
 
 		 518 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  32.82 
 
 		 518 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  35.17 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  35.17 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  35.17 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.17 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  32.82 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.17 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.85 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.14 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.85 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  34.77 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.39 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  34.45 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  30.58 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.75 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  32.38 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  33.72 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  30.14 
 
 		 506 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  30.14 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  30.14 
 
 		 506 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  30.16 
 
 		 515 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  30.26 
 
 		 506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  45.14 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  29.71 
 
 		 526 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  29.71 
 
 		 526 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  29.67 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.53 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  46.53 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  46.53 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  46.53 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.53 
 
 		 1466 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.53 
 
 		 1494 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.76 
 
 		 516 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0427  sensory box protein  39.85 
 
 		 1491 aa  193  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.15 
 
 		 1487 aa  193  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.38 
 
 		 516 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  31.38 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  31.31 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5086  diguanylate phosphodiesterase  31.14 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.37 
 
 		 516 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  34.51 
 
 		 525 aa  189  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.39 
 
 		 1497 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.996532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.39 
 
 		 1497 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.39 
 
 		 1497 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.39 
 
 		 1490 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982948  hitchhiker  0.0000000550616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0422  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.26 
 
 		 1492 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.144881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.01 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.13 
 
 		 1485 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165291 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  28.71 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 		 534 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3380  GGDEF domain-containing protein  39.38 
 
 		 1479 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  40.65 
 
 		 687 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5670  diguanylate phosphodiesterase  32.14 
 
 		 529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.24 
 
 		 685 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  30.57 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  31.67 
 
 		 588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0378  sensory box protein  38.93 
 
 		 1491 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0214422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  39.92 
 
 		 685 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  40.87 
 
 		 1534 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>