More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1425 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1082    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  98.68 
 
 
532 aa  1072    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  37.29 
 
 
506 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  37.29 
 
 
506 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  36.99 
 
 
506 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  38.01 
 
 
535 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  38.01 
 
 
534 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  36.61 
 
 
506 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  36.39 
 
 
519 aa  189  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  33.23 
 
 
518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  34.69 
 
 
530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  34.77 
 
 
525 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  38.61 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  34.78 
 
 
515 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  30.52 
 
 
529 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  37.05 
 
 
514 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  33.33 
 
 
374 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  35.66 
 
 
518 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  35.66 
 
 
518 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  35.66 
 
 
518 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  35.66 
 
 
518 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  35.66 
 
 
518 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  35.66 
 
 
518 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  37.41 
 
 
537 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  35.66 
 
 
497 aa  178  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  35.66 
 
 
518 aa  178  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  34.1 
 
 
528 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  35.14 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3557  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.67 
 
 
677 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.026762  decreased coverage  0.00000188852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  37.5 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  36.86 
 
 
530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.09 
 
 
684 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0216958  hitchhiker  0.00000239027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1095  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.09 
 
 
684 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10926  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1208  GGDEF domain-containing protein  36.09 
 
 
684 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1034  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.09 
 
 
674 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20154  hitchhiker  0.000000435621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.02 
 
 
677 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2830  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.43 
 
 
682 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0701966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.93 
 
 
516 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  36.86 
 
 
522 aa  172  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.22 
 
 
891 aa  171  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  34.74 
 
 
518 aa  170  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.27 
 
 
516 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  36.51 
 
 
526 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  36.51 
 
 
526 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  34.93 
 
 
516 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.46 
 
 
692 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.93 
 
 
516 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  34.93 
 
 
516 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.43 
 
 
516 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  31.6 
 
 
526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3413  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.71 
 
 
684 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.341259  hitchhiker  0.0009308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3276  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.71 
 
 
684 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1132  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  35.71 
 
 
684 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00732829  unclonable  0.0000000000153183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3235  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.85 
 
 
684 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.612111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.09 
 
 
533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  34.81 
 
 
501 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  31.43 
 
 
538 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.09 
 
 
533 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1682  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.07 
 
 
958 aa  167  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.532324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  28.21 
 
 
520 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.09 
 
 
533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  33.2 
 
 
535 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0965  GGDEF domain-containing protein  34.87 
 
 
680 aa  166  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00724002  normal  0.0458332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  33.2 
 
 
532 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  36.05 
 
 
988 aa  166  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0914  GGDEF domain-containing protein  35.11 
 
 
693 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398639  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  33.2 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.11 
 
 
694 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479212  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1018  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 
678 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.65 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2200  EAL domain protein  29.23 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2120  GGDEF domain-containing protein  37.96 
 
 
720 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.09 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0994  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.87 
 
 
678 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.031573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  34.8 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.11 
 
 
683 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  31.51 
 
 
528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2322  GGDEF family protein  35.57 
 
 
849 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.04 
 
 
1052 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.697707  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.3 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.3 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.94 
 
 
533 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.35 
 
 
683 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.94 
 
 
533 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.94 
 
 
533 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  32.3 
 
 
516 aa  163  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  32.3 
 
 
516 aa  163  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.6 
 
 
568 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00246734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.94 
 
 
474 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.94 
 
 
460 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.29 
 
 
739 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2823  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.5 
 
 
677 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.992425  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.3 
 
 
518 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4487  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.97 
 
 
683 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  32.54 
 
 
521 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.47 
 
 
729 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.447802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>