More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2897 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2897  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0964  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1016  transcriptional regulator, CadC  41.43 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.483037  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  39.78 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02470  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  35.35 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  38.46 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  34 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.82 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  34.94 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  36.76 
 
 		 711 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 		 729 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  42.86 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  35.9 
 
 		 225 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1875  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  39.24 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  34.72 
 
 		 580 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  36.47 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03550  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.26 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 591 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.03 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  36.92 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  32.65 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.44 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.65 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.65 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  35.38 
 
 		 531 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.65 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  40.85 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0365  DNA-binding response regulator SaeR  34.74 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  36.23 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0355  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  36.23 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.73 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 518 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0746  response regulator receiver  34.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0730  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  34.67 
 
 		 520 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 468 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.12 
 
 		 945 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 481 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 591 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  36.23 
 
 		 479 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 230 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  33.33 
 
 		 717 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  27.21 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2494  DNA-binding transcriptional activator CadC  24.43 
 
 		 542 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  37.18 
 
 		 219 aa  49.3  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.59 
 
 		 514 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.85 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  33.82 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  34.62 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0337  putative response regulator ArlR  37.97 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  34.62 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.59 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  30.99 
 
 		 725 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  36 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.59 
 
 		 514 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.59 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  29.9 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  31.08 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.12 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  32.53 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  30.68 
 
 		 521 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1927  two component transcriptional regulator  36.9 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0440711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.63 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  34.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4752  response regulator  31.87 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 658 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.65 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  27.14 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  35.38 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  34.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>