More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2532 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2532  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 103 aa  213  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  86.41 
 
 		 402 aa  194  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  76.47 
 
 		 402 aa  173  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  75.49 
 
 		 402 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  74.51 
 
 		 402 aa  169  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  74.51 
 
 		 402 aa  169  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  74.51 
 
 		 402 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  74.51 
 
 		 402 aa  167  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  73.53 
 
 		 402 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  72.55 
 
 		 402 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  72.55 
 
 		 382 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  72.55 
 
 		 382 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  72.55 
 
 		 402 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  72.55 
 
 		 402 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  72.55 
 
 		 402 aa  163  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  78.05 
 
 		 387 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  70 
 
 		 399 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  57.01 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  54.21 
 
 		 411 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  54.21 
 
 		 413 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  54.63 
 
 		 411 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  53.27 
 
 		 411 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  53.27 
 
 		 411 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  54.55 
 
 		 400 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  55.21 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  53.09 
 
 		 403 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  53.09 
 
 		 406 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  53.09 
 
 		 403 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  50 
 
 		 435 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  53.09 
 
 		 403 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  54.43 
 
 		 219 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  54.43 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  55.26 
 
 		 348 aa  98.6  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  55.26 
 
 		 348 aa  98.6  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  53.25 
 
 		 348 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  50.5 
 
 		 431 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  45 
 
 		 422 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  44.55 
 
 		 397 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  44.55 
 
 		 397 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  45.16 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  45.16 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  36.73 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.75 
 
 		 399 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  46.75 
 
 		 399 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  50 
 
 		 361 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  38.75 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  47.89 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  40.26 
 
 		 429 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  47.83 
 
 		 396 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  50.63 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  50.63 
 
 		 439 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  37.76 
 
 		 415 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.69 
 
 		 398 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  39.39 
 
 		 417 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  41.25 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.44 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.44 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.44 
 
 		 401 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  40 
 
 		 381 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.78 
 
 		 381 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  41.86 
 
 		 368 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.43 
 
 		 403 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  40.74 
 
 		 387 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  44.58 
 
 		 416 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  43.4 
 
 		 399 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1123  transposase, IS605 OrfB family  44.62 
 
 		 395 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.144055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0712  transposase, IS605 OrfB family  44.62 
 
 		 506 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0526534  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  41.67 
 
 		 368 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  44.16 
 
 		 399 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 		 385 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.16 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  43.37 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  41.86 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  48.78 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  45.83 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.36 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  41.33 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  46.84 
 
 		 425 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  41.18 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  45.57 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  40.7 
 
 		 368 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6076  hypothetical protein  59.26 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.537115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  40.79 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  43.37 
 
 		 377 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  40.7 
 
 		 368 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  46.27 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  38.38 
 
 		 518 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  44.19 
 
 		 408 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5924  transposase IS605 OrfB  48.1 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  39.78 
 
 		 410 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  43.37 
 
 		 377 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.11 
 
 		 517 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  40.24 
 
 		 390 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  40.7 
 
 		 368 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  35.42 
 
 		 414 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  40.7 
 
 		 368 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  46.27 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  46.27 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>