More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5691 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 396 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  75.06 
 
 		 398 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  74.49 
 
 		 401 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  73.3 
 
 		 396 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  75 
 
 		 403 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  74.24 
 
 		 403 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  72.68 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  75.44 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  43.08 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  43.08 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  35.77 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  37.17 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  38.6 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  36.05 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  38.56 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  38.56 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  36.96 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  35.5 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  36.46 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  36.46 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  36.46 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  34.74 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  36.8 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  36.46 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  36.46 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  36.81 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  35.06 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  36.65 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  36.04 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  34.83 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  33.75 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  36.65 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  36.65 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  36.04 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  41.09 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  36.13 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  36.34 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  35.73 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  36.53 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  35.92 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  35.31 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.32 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.69 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  36.47 
 
 		 348 aa  211  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  39.26 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  35.87 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  35.87 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  39.79 
 
 		 386 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.52 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.78 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  36.3 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  37.53 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  35.62 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  35.58 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.53 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.53 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  33.33 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  33.33 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  36.08 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  33.42 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  35.31 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  31.89 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  32.2 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  37.89 
 
 		 231 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.08 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  40.1 
 
 		 219 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  31.82 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  26.53 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  26.53 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  26.53 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  26.53 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  26.53 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  32.86 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.97 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.64 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.64 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  30.67 
 
 		 383 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  26.39 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  32.11 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  26.9 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  30.15 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  30.15 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  30.15 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  30.15 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  26.36 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  26.36 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  26.68 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  31.58 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  26.36 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  32.51 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  30.79 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  26.09 
 
 		 372 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  26.36 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  29.92 
 
 		 367 aa  140  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.08 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  29.92 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  29.64 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.64 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  26.39 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>