More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3236 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  100 
 
 		 399 aa  833    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  63.96 
 
 		 387 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  64.58 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  65.1 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  64.58 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  64.32 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  64.32 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  64.32 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  63.8 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  62.44 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  63.54 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  63.8 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  63.54 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  65.66 
 
 		 382 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  65.66 
 
 		 382 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  59.9 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  57.11 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  52.06 
 
 		 435 aa  401  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  48.84 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  48.33 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  47.69 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  48.21 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  48.46 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.08 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  47.81 
 
 		 411 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  48.82 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  46.53 
 
 		 411 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  47.18 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.74 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  46.42 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  45.45 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  45.45 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  45.91 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  45.66 
 
 		 408 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  50 
 
 		 348 aa  317  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  50 
 
 		 348 aa  317  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  50.78 
 
 		 348 aa  312  5.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  41.12 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  57.27 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  58.49 
 
 		 219 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  35.1 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  35.1 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.47 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.47 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.53 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 		 416 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  35.25 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  36.13 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  33.91 
 
 		 373 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  33.91 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  33.66 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  33.66 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  35.29 
 
 		 415 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.91 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.91 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.91 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.25 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  33 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  34.92 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.69 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.34 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  34.92 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.81 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  33.75 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  32.75 
 
 		 372 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.42 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.2 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.86 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  32.75 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  37.08 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.64 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  34.28 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.01 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.46 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  33.58 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  33.16 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  33.16 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  34.63 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.31 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  32.99 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.23 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.16 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  32.63 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  32.9 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.66 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  32.65 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  33.07 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  32.73 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  32.38 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  32.17 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.9 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  32.62 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  31.97 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  33.84 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  30.79 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>