More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3880 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  82.08 
 
 		 413 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  78.54 
 
 		 411 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 411 aa  856    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  86.37 
 
 		 411 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  78.1 
 
 		 411 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  77.37 
 
 		 411 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  65.2 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  60.25 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  59.75 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  59.26 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  58.56 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  59.06 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  59.06 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  59.06 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  59.06 
 
 		 402 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  59.06 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  61.4 
 
 		 403 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  60.63 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  59.06 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  57.88 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  62.04 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  61.14 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  58.81 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  61.14 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  58.49 
 
 		 382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  58.49 
 
 		 382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  60.63 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  59.94 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  59.94 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  53.68 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  49.52 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  46.42 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  41.29 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  44.56 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  44.56 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.59 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  42.05 
 
 		 408 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  41.79 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  60.18 
 
 		 231 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  61.5 
 
 		 219 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  38.36 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  38.36 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  37.9 
 
 		 417 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  36.25 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.06 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  34.71 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  34.71 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  34.47 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  35.99 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  36.44 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  34.36 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.59 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  36.59 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.92 
 
 		 424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  34.16 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  35.37 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  36.17 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  35.17 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.9 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  33.99 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  35.9 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  35.9 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.51 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.51 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  35.9 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  34.04 
 
 		 363 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.64 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.88 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.64 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.88 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.9 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  32.24 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 363 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  33.67 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  33.76 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  33.42 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  33.42 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.11 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  33.42 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.03 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  35.01 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.3 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  32.91 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.25 
 
 		 405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  37.95 
 
 		 332 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>