More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2805 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  100 
 
 		 416 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  73.64 
 
 		 381 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  72.28 
 
 		 381 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  68.85 
 
 		 408 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  70.27 
 
 		 373 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  66.57 
 
 		 367 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  66.57 
 
 		 367 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  63.39 
 
 		 377 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  55.64 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  53.48 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  56.56 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  51.6 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  52.25 
 
 		 391 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  53.72 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  52.79 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  53.17 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  51.86 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  54.52 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  52.91 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  54.99 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  53.28 
 
 		 410 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  53.37 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  51.74 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  52.82 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  53.1 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  52.82 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  50.94 
 
 		 377 aa  362  6e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  50.67 
 
 		 377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  46.85 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  47.35 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  45.24 
 
 		 424 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  43.09 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  42.74 
 
 		 392 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  42.74 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  42.74 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  46.07 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  43.6 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  43.6 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  42.06 
 
 		 392 aa  299  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  43.6 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  43.6 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  42.18 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  43.05 
 
 		 403 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  41.19 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  40.91 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.16 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  40.91 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  40.91 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  40.95 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  42.33 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  42.33 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  42.33 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  42.78 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  42.61 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  45.71 
 
 		 326 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  43.01 
 
 		 404 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  43.01 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  42.09 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  40.22 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  40.92 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  39.62 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.8 
 
 		 372 aa  272  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  40.71 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  47.4 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  43.08 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  38.65 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  40.27 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  39.78 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  38.92 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  38.7 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  39.78 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  39.9 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  38.65 
 
 		 373 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  38.65 
 
 		 373 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  38.65 
 
 		 373 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  39.58 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  39.58 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  41.6 
 
 		 435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.38 
 
 		 372 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  39.08 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  41.6 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  41.6 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  37.84 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  37.57 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  36.91 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  39.53 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37.84 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  37.84 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.36 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  38.63 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  37.96 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  39.51 
 
 		 369 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  39.51 
 
 		 369 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  39.51 
 
 		 369 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.4 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  39.51 
 
 		 369 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  39.51 
 
 		 369 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.34 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>