More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1309 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0499  transposase  84.31 
 
 
450 aa  749    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  100 
 
 
427 aa  888    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  85.46 
 
 
392 aa  703    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  81.73 
 
 
393 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  97.44 
 
 
392 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  98.97 
 
 
390 aa  798    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  86.73 
 
 
392 aa  716    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  76.86 
 
 
403 aa  548  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  57.26 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  57.89 
 
 
384 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1184  transposase IS605  57.45 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  44.16 
 
 
367 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  43.87 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  45.66 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.68 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.72 
 
 
376 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  45.1 
 
 
408 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  42.74 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.86 
 
 
381 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  44.04 
 
 
368 aa  299  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  42.74 
 
 
373 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  44.17 
 
 
381 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  41.8 
 
 
377 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  41.78 
 
 
383 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  41.44 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.83 
 
 
403 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  41.32 
 
 
410 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.97 
 
 
381 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  40.27 
 
 
403 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  40.27 
 
 
403 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  40.27 
 
 
403 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  40.27 
 
 
403 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 
403 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  41.05 
 
 
410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  42.15 
 
 
410 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  41.99 
 
 
405 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  38.32 
 
 
390 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.69 
 
 
395 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  40.44 
 
 
391 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  41.16 
 
 
377 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  40.94 
 
 
375 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  39.9 
 
 
417 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  38.66 
 
 
404 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  38.66 
 
 
404 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  40.88 
 
 
377 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  38.33 
 
 
384 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  38.8 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  40.88 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.63 
 
 
396 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  38.67 
 
 
383 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.42 
 
 
399 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  38.59 
 
 
394 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  38.59 
 
 
394 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  40.45 
 
 
425 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  39.94 
 
 
406 aa  249  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  38.23 
 
 
391 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  39.35 
 
 
405 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  39.35 
 
 
405 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  36.91 
 
 
383 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  36.91 
 
 
383 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.29 
 
 
461 aa  245  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  37.01 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  38.79 
 
 
424 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  37.85 
 
 
383 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  37.85 
 
 
383 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  37.85 
 
 
383 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 
435 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  37.85 
 
 
383 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  38.56 
 
 
416 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  36.89 
 
 
377 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.27 
 
 
402 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  35.05 
 
 
382 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  36.39 
 
 
383 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  35.39 
 
 
382 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.83 
 
 
373 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  36.68 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.56 
 
 
373 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  38.03 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.31 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  35.28 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  37.91 
 
 
370 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  34.75 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.03 
 
 
372 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  35.01 
 
 
370 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.03 
 
 
372 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  35.75 
 
 
397 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  34.13 
 
 
370 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  35.03 
 
 
373 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  35.01 
 
 
393 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  35.75 
 
 
397 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  33.87 
 
 
370 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  35.03 
 
 
373 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  35.03 
 
 
373 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  35.03 
 
 
373 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.76 
 
 
372 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  35.03 
 
 
372 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  39.23 
 
 
399 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  39.23 
 
 
399 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  35.6 
 
 
402 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>