More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1520 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0499  transposase  81.73 
 
 
450 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  81.73 
 
 
427 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  88.51 
 
 
403 aa  634    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  81.73 
 
 
392 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  100 
 
 
393 aa  817    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  80.66 
 
 
392 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  81.54 
 
 
390 aa  651    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  81.73 
 
 
392 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  58.31 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  58.95 
 
 
384 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1184  transposase IS605  59.32 
 
 
323 aa  349  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  45.56 
 
 
381 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  42.98 
 
 
367 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.2 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  46.13 
 
 
408 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  43.09 
 
 
416 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.05 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  42.7 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  44.96 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.47 
 
 
376 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  43.8 
 
 
373 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  41.42 
 
 
377 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  42.66 
 
 
405 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  43.27 
 
 
381 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  41.89 
 
 
403 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  41.89 
 
 
403 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  41.89 
 
 
403 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  41.89 
 
 
403 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  41.62 
 
 
403 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.78 
 
 
381 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  42.34 
 
 
383 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  42.39 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  42.93 
 
 
410 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.64 
 
 
403 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  42.93 
 
 
410 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  42.12 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  43.48 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.47 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  42.51 
 
 
377 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  43.32 
 
 
375 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  43.05 
 
 
377 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  40.59 
 
 
417 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  40.5 
 
 
391 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 
383 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  40.5 
 
 
383 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  39.68 
 
 
390 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
391 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.96 
 
 
383 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
383 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  37.12 
 
 
373 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
383 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
383 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
383 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.96 
 
 
383 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
391 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  39 
 
 
384 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.53 
 
 
396 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  39.53 
 
 
416 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  40.55 
 
 
406 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  36.53 
 
 
373 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.32 
 
 
399 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  40.16 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  39.19 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  36.53 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  38.54 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  38.54 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  36.27 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  37.73 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  36.27 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  36.27 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  37.73 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  39.45 
 
 
383 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  36.53 
 
 
372 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  37.47 
 
 
405 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  36.14 
 
 
382 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  36 
 
 
372 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  38.85 
 
 
402 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  39.67 
 
 
370 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  36.14 
 
 
377 aa  249  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  36 
 
 
372 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  39.7 
 
 
425 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  36.27 
 
 
373 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  36 
 
 
372 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.11 
 
 
461 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  38.79 
 
 
405 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  38.79 
 
 
405 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  36.72 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  39.53 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  37.11 
 
 
402 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  37.11 
 
 
402 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  36.72 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  35.48 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  37.11 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  39.12 
 
 
370 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.84 
 
 
383 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  35.58 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  36 
 
 
394 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  35.31 
 
 
378 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.75 
 
 
370 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  37.87 
 
 
391 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>