More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4184 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
367 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  99.18 
 
 
367 aa  757    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  67.21 
 
 
381 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  66.57 
 
 
416 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  66.94 
 
 
381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  66.67 
 
 
408 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  64.75 
 
 
373 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  62.6 
 
 
377 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  55.68 
 
 
390 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  55.98 
 
 
395 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  55.56 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  54.59 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  53.53 
 
 
410 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  54.32 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  53.51 
 
 
391 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  51.63 
 
 
405 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  53.61 
 
 
368 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  52.45 
 
 
410 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.9 
 
 
376 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  52.45 
 
 
405 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  52.45 
 
 
410 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.73 
 
 
381 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.22 
 
 
381 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  49.73 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  48.49 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  47.43 
 
 
377 aa  342  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  48.51 
 
 
377 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  45.51 
 
 
406 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  48.51 
 
 
377 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  44.16 
 
 
427 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  44.16 
 
 
392 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  44.16 
 
 
390 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  45.18 
 
 
393 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  47.11 
 
 
362 aa  316  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  42.7 
 
 
450 aa  311  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  42.7 
 
 
392 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  42.98 
 
 
393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  43.02 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  41.79 
 
 
424 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  45.36 
 
 
384 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  44.35 
 
 
403 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  44.35 
 
 
403 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  44.35 
 
 
403 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  44.35 
 
 
403 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  42.94 
 
 
383 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  42.94 
 
 
383 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  44.08 
 
 
403 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  45.33 
 
 
384 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  43.13 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  43.13 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  41.13 
 
 
383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  41.13 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  41.55 
 
 
403 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  42.25 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  42.25 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  42.25 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  43.09 
 
 
404 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  42.74 
 
 
396 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  43.09 
 
 
404 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  41.97 
 
 
383 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  42.16 
 
 
370 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  46.23 
 
 
326 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  41.69 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  41.22 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  42.51 
 
 
399 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.98 
 
 
461 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  40.11 
 
 
416 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 
405 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  43.18 
 
 
405 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  43.18 
 
 
405 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  38.67 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  40.38 
 
 
402 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  39.07 
 
 
382 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  38.67 
 
 
397 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  39.83 
 
 
373 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  39.55 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 
403 aa  256  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  38.48 
 
 
377 aa  255  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  39.55 
 
 
372 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  39.28 
 
 
373 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  39.28 
 
 
373 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  39.28 
 
 
373 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  39 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  39.28 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  39.28 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.71 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  39.57 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  39.07 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  39.28 
 
 
372 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  47.22 
 
 
299 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.8 
 
 
402 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  37.7 
 
 
413 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  37.7 
 
 
413 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  37.7 
 
 
413 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  38.21 
 
 
369 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  38.21 
 
 
369 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  38.21 
 
 
369 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  38.21 
 
 
369 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>