More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1890 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  94.14 
 
 
326 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  84.48 
 
 
377 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  82.41 
 
 
377 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  80.97 
 
 
375 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  82.41 
 
 
377 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  64.83 
 
 
368 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  65.51 
 
 
410 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.08 
 
 
376 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  63.76 
 
 
410 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  63.07 
 
 
405 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  61.62 
 
 
381 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  64.46 
 
 
405 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  64.11 
 
 
410 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  61.28 
 
 
381 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  62.29 
 
 
381 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  51.04 
 
 
395 aa  288  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  50.52 
 
 
391 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  50.17 
 
 
391 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  52.45 
 
 
390 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  49.48 
 
 
391 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  51.74 
 
 
381 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  48.97 
 
 
403 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  50.69 
 
 
381 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  47.4 
 
 
416 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  45.49 
 
 
377 aa  265  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  48.96 
 
 
373 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  48.96 
 
 
408 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  47.22 
 
 
367 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  47.22 
 
 
367 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  45 
 
 
424 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  44.14 
 
 
406 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  39.32 
 
 
403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  39.32 
 
 
403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  39.32 
 
 
403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  39.32 
 
 
403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  38.64 
 
 
403 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  38.49 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  38.49 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  38.49 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  39.32 
 
 
393 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  37.93 
 
 
384 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  39.12 
 
 
370 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  38.14 
 
 
383 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  38.44 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  37.46 
 
 
383 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  37.46 
 
 
383 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  36.3 
 
 
370 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  37.46 
 
 
383 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  37.5 
 
 
435 aa  188  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.64 
 
 
370 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  37.59 
 
 
383 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  35.27 
 
 
370 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  36.3 
 
 
370 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  37.72 
 
 
362 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  37.11 
 
 
383 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  36.64 
 
 
393 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  35.96 
 
 
370 aa  185  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  35.96 
 
 
393 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  35.76 
 
 
440 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  35.4 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  37.33 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  34.71 
 
 
370 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  36.64 
 
 
370 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  39.53 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  37.54 
 
 
396 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  36.82 
 
 
393 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  37.71 
 
 
403 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.56 
 
 
370 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  36.15 
 
 
404 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  36.9 
 
 
399 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  36.15 
 
 
404 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  37.8 
 
 
392 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  37.8 
 
 
390 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  37.8 
 
 
427 aa  175  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  32.18 
 
 
384 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  38.36 
 
 
394 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  38.36 
 
 
394 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  32.18 
 
 
384 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.69 
 
 
373 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.69 
 
 
373 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.69 
 
 
373 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.35 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  40.43 
 
 
425 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.47 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  34.21 
 
 
383 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  32.18 
 
 
384 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  35.27 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.69 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  32.18 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  31.66 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  31.86 
 
 
384 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  31.86 
 
 
384 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  38.49 
 
 
392 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.55 
 
 
383 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  34.69 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.93 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  38.14 
 
 
392 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  31.55 
 
 
384 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  38.14 
 
 
450 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>