More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4039 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 377 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  85.68 
 
 		 377 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  86.47 
 
 		 377 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  84.84 
 
 		 375 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  80.12 
 
 		 326 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  84.48 
 
 		 299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  65.66 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  63.66 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  63.98 
 
 		 376 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  63.07 
 
 		 381 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  62.86 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  61.54 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  64.46 
 
 		 410 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  63.4 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  64.69 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  64.15 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  53.72 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  52.65 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  52.39 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  52.91 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  52.93 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  52.94 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  54.3 
 
 		 381 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  53.76 
 
 		 381 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  52.82 
 
 		 416 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  52.15 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  51.87 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  47.44 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  47.43 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  47.15 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  45.45 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  45.83 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  41.09 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  43.44 
 
 		 403 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  43.44 
 
 		 403 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  43.44 
 
 		 403 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  43.44 
 
 		 403 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  42.9 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  41.71 
 
 		 384 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  42.33 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  42.12 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  41 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  40.71 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.09 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.53 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  39.89 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  40.56 
 
 		 370 aa  272  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  40.16 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.51 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  40.16 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  42.28 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  41.41 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  39.34 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  39.45 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  39.62 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  41.71 
 
 		 392 aa  268  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  39.61 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  41.16 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  41.16 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  40.16 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  39.9 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  39.9 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  41.99 
 
 		 450 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  41.99 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  41.96 
 
 		 435 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.71 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.38 
 
 		 440 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  40.83 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.57 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  39.78 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  37.95 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  37.95 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  39.06 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  39.17 
 
 		 383 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  41.38 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  39.3 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  37.95 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  38.23 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  37.28 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  37.28 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  38.23 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  38.23 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  38.23 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.23 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  37.02 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  37.02 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  37.02 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  37.4 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  37.4 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  37.28 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37.67 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  43.55 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  38.44 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>