More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1924 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  84.69 
 
 
405 aa  703    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  90.12 
 
 
410 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  92.35 
 
 
410 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
405 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  87.1 
 
 
410 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  72.88 
 
 
368 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  68.1 
 
 
376 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  67.56 
 
 
381 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  69.71 
 
 
381 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  68.1 
 
 
381 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  58.72 
 
 
391 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  59.69 
 
 
395 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  65.25 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  63.4 
 
 
377 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  57.69 
 
 
391 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  59.42 
 
 
390 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  65.52 
 
 
377 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  56.78 
 
 
391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  57.37 
 
 
403 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  62.07 
 
 
375 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  56.99 
 
 
381 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 
408 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  54.45 
 
 
381 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  54.52 
 
 
416 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  54.67 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  51.89 
 
 
377 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  52.45 
 
 
367 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  52.17 
 
 
367 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  50.84 
 
 
424 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  59.81 
 
 
326 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  64.46 
 
 
299 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  51.49 
 
 
406 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  45.19 
 
 
403 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  45.19 
 
 
403 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  45.19 
 
 
403 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  45.19 
 
 
403 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  44.92 
 
 
403 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  43.78 
 
 
362 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  46.07 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  42.05 
 
 
435 aa  295  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.73 
 
 
370 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  43.47 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  43.48 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  42.27 
 
 
392 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  42.3 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  41.99 
 
 
427 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  42.3 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  42.3 
 
 
383 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  41.99 
 
 
390 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  42.02 
 
 
383 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.1 
 
 
405 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  42.02 
 
 
383 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  42.02 
 
 
383 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  38.38 
 
 
373 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  43.41 
 
 
450 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  43.41 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  42.63 
 
 
394 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  37.87 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  40.45 
 
 
417 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  37.6 
 
 
373 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.06 
 
 
440 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  37.6 
 
 
373 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  37.6 
 
 
373 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  37.87 
 
 
372 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 
394 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 
394 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  37.6 
 
 
372 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  42.86 
 
 
392 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37.6 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  37.6 
 
 
372 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  37.94 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  44.41 
 
 
384 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  37.06 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.94 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.48 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  38.21 
 
 
370 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  36.88 
 
 
383 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  40.42 
 
 
384 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  37.03 
 
 
370 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  38.08 
 
 
370 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  38.48 
 
 
370 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  36.88 
 
 
383 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  38.21 
 
 
370 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  38.21 
 
 
393 aa  260  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  35.51 
 
 
383 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  38.48 
 
 
393 aa  259  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  37.02 
 
 
384 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  39.63 
 
 
403 aa  256  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  38.07 
 
 
396 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  36.72 
 
 
384 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  38.77 
 
 
371 aa  255  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  37.67 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  39.07 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  36.72 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  39.07 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  36.2 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  39.08 
 
 
385 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>