More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1784 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 375 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  84.04 
 
 		 377 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  84.84 
 
 		 377 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  84.84 
 
 		 377 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  78.19 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  65.75 
 
 		 368 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  80.97 
 
 		 299 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  63.13 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.16 
 
 		 376 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  62.33 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  62.86 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.92 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  62.07 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  62.86 
 
 		 410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  62.26 
 
 		 381 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  61.46 
 
 		 381 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  55.61 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  54.26 
 
 		 395 aa  421  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  52.66 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  52.66 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  53.19 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  52.55 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  54.32 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  51.74 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  52.16 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  51.89 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  51.21 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  48.78 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  48.49 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  48.49 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  43.83 
 
 		 424 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  46.6 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  44.01 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  42.18 
 
 		 362 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  40.84 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  40.84 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  40.84 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  40.84 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  40.31 
 
 		 403 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  43.32 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  41.04 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  42.43 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  40.94 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  41.05 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  40.94 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  40.95 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  40.95 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  40.95 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  42.27 
 
 		 450 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  42.27 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  40.67 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  40.6 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  43.46 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  40.67 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  40.67 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.06 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.21 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  38.61 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.24 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.32 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  40.4 
 
 		 417 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  38.98 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  38.98 
 
 		 404 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  37.5 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  37.89 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.06 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  37.63 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  38.04 
 
 		 370 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  42.12 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  37.63 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  37.57 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  39.17 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  38.04 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  39.5 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  39.5 
 
 		 383 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  37.37 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  37.47 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  37.78 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.19 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  36.74 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  37.78 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  37.78 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.48 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  42.36 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  37.37 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  37.77 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  38.48 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  37.37 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  37.11 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37.78 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  37.11 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  38.22 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.33 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  37.11 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  37.11 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  37.11 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  36.86 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>