More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1819 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  87.16 
 
 
405 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  92.35 
 
 
405 aa  755    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  86.1 
 
 
410 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  90.98 
 
 
410 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
410 aa  838    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  72.33 
 
 
368 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  69.17 
 
 
381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  69.44 
 
 
376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  69.87 
 
 
381 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  69.44 
 
 
381 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  63.66 
 
 
377 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  60.21 
 
 
395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  58.72 
 
 
391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  64.19 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  57.18 
 
 
391 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  58.38 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  56.27 
 
 
391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  64.72 
 
 
377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  57.37 
 
 
403 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  62.86 
 
 
375 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  57.8 
 
 
381 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  57.53 
 
 
408 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  55.64 
 
 
416 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  55.35 
 
 
381 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  52.97 
 
 
377 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  55.73 
 
 
373 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  53.53 
 
 
367 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  53.26 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  60.43 
 
 
326 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  65.51 
 
 
299 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  51.08 
 
 
424 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  52.49 
 
 
406 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  44.65 
 
 
403 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  44.65 
 
 
403 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  44.65 
 
 
403 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  44.65 
 
 
403 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  44.39 
 
 
403 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  43.28 
 
 
362 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  45.41 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  44.27 
 
 
370 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  42.12 
 
 
435 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  43.47 
 
 
370 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  42.43 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  42.39 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  40.36 
 
 
440 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  44.65 
 
 
394 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  39.19 
 
 
373 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  38.92 
 
 
373 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  41.6 
 
 
392 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.36 
 
 
405 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  41.11 
 
 
383 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  41.32 
 
 
427 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  41.32 
 
 
390 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  41.58 
 
 
450 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  41.58 
 
 
392 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  40.83 
 
 
383 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  40.83 
 
 
383 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  40.93 
 
 
383 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  40.93 
 
 
383 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  38.38 
 
 
373 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  38.38 
 
 
373 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  38.38 
 
 
373 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  41.95 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  39.31 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  41.13 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  38.18 
 
 
383 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  41.13 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  38.18 
 
 
383 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.75 
 
 
372 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  43.78 
 
 
384 aa  272  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.89 
 
 
396 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  38.92 
 
 
373 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  38.46 
 
 
372 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  38.46 
 
 
372 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.76 
 
 
392 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
383 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  39.08 
 
 
399 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.42 
 
 
370 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  37.06 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  37.87 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.06 
 
 
370 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  38.15 
 
 
370 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  37.79 
 
 
384 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  37.53 
 
 
384 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  38.15 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  37.47 
 
 
370 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  37.07 
 
 
373 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  36.68 
 
 
370 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  37.87 
 
 
393 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  37.79 
 
 
384 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  38.42 
 
 
393 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  40.21 
 
 
404 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  40.21 
 
 
404 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.57 
 
 
402 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  37.53 
 
 
384 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  43.08 
 
 
425 aa  259  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>