More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3063 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  100 
 
 
377 aa  787    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  61.66 
 
 
381 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  63.39 
 
 
416 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  62.47 
 
 
408 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  62.6 
 
 
367 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  60.96 
 
 
373 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  62.06 
 
 
367 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.05 
 
 
381 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  52.97 
 
 
410 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  50.54 
 
 
405 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  52.29 
 
 
395 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  53.1 
 
 
403 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  52.62 
 
 
368 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  51.61 
 
 
391 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  50.94 
 
 
391 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  51.08 
 
 
410 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  51.89 
 
 
405 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  50.13 
 
 
391 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  50.94 
 
 
390 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  51.89 
 
 
410 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.6 
 
 
376 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.17 
 
 
381 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  48.78 
 
 
375 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  47.44 
 
 
377 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.25 
 
 
381 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  47.44 
 
 
381 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  47.71 
 
 
377 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  47.71 
 
 
377 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  44.21 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  44.54 
 
 
383 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  44.54 
 
 
383 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  44.54 
 
 
383 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  43.98 
 
 
383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  44.26 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  43.7 
 
 
383 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  45.77 
 
 
384 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  43.98 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  43.98 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  43.33 
 
 
406 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  44.26 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  44.15 
 
 
384 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 
424 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  44.97 
 
 
396 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  41.42 
 
 
393 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  43.31 
 
 
404 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  43.31 
 
 
404 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  41.8 
 
 
392 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  41.8 
 
 
427 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  41.8 
 
 
390 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.5 
 
 
370 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  43.5 
 
 
370 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  40.87 
 
 
403 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  40.87 
 
 
403 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  40.87 
 
 
403 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  40.87 
 
 
403 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  44.18 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  40.6 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  39.95 
 
 
450 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  39.95 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  40.21 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  42.22 
 
 
405 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  40.36 
 
 
417 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  39.02 
 
 
383 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  45.03 
 
 
326 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  42.13 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  39.52 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  39.52 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  42.13 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  39.52 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  38.34 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  38.34 
 
 
383 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  44.26 
 
 
405 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  39.3 
 
 
373 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  44.26 
 
 
405 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  39.57 
 
 
373 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 
440 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  45.68 
 
 
326 aa  269  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  38.79 
 
 
372 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  40.32 
 
 
382 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.73 
 
 
372 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  38.73 
 
 
372 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  41.24 
 
 
391 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.49 
 
 
299 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  38.52 
 
 
372 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  39.13 
 
 
416 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.51 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  38.3 
 
 
373 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  40.22 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  40.22 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  38.46 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 
402 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.37 
 
 
461 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  39.35 
 
 
377 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  37.63 
 
 
384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  39.05 
 
 
425 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  39.78 
 
 
382 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  37.79 
 
 
384 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  37.79 
 
 
384 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  37.53 
 
 
384 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  42.08 
 
 
362 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>