More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1501 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1093  transposase  99.75 
 
 
397 aa  821    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  100 
 
 
397 aa  823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  81.33 
 
 
391 aa  678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  61.77 
 
 
299 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  45.93 
 
 
404 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  45.93 
 
 
404 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  44.08 
 
 
394 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  44.08 
 
 
394 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  43.8 
 
 
461 aa  335  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  44.59 
 
 
405 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  44.08 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  44.5 
 
 
384 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  44.33 
 
 
396 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  42 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  43.05 
 
 
405 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  43.05 
 
 
405 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  42.78 
 
 
370 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  42.78 
 
 
370 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  41.98 
 
 
370 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  42.25 
 
 
370 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  42.82 
 
 
394 aa  298  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  42.78 
 
 
393 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  41.98 
 
 
393 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  41.98 
 
 
370 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  41.98 
 
 
370 aa  296  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2489  IS605 family transposase OrfB  60.08 
 
 
256 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  41.71 
 
 
370 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  41.76 
 
 
370 aa  293  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  45.67 
 
 
386 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  42.82 
 
 
370 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  40.16 
 
 
402 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  41.33 
 
 
372 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  41.94 
 
 
383 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  41.08 
 
 
383 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  41.08 
 
 
383 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  41.08 
 
 
383 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  39.51 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  40.81 
 
 
383 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
373 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  39.25 
 
 
373 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  39.25 
 
 
373 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  39.25 
 
 
373 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  40.64 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  45.39 
 
 
304 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  40.64 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  40.64 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  40.64 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  40.64 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  39.41 
 
 
373 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
377 aa  266  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  38.71 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  41.49 
 
 
408 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 
383 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  38.71 
 
 
373 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  38.36 
 
 
372 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  38.93 
 
 
382 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  38.79 
 
 
372 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  39.2 
 
 
382 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.59 
 
 
381 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  38.28 
 
 
381 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  40.22 
 
 
377 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  38.1 
 
 
372 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.25 
 
 
401 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  37.15 
 
 
388 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  38.67 
 
 
367 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  39.58 
 
 
416 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  39.68 
 
 
370 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.17 
 
 
372 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  38.4 
 
 
367 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  38.68 
 
 
378 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  39.14 
 
 
370 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  38.34 
 
 
373 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  42.48 
 
 
311 aa  252  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
326 aa  252  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  38.32 
 
 
362 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  38.5 
 
 
403 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  36.1 
 
 
384 aa  249  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  36.1 
 
 
384 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  36.36 
 
 
384 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  35.84 
 
 
384 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  35.84 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  35.84 
 
 
384 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  35.68 
 
 
384 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  35.84 
 
 
384 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 
417 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.2 
 
 
381 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  35.84 
 
 
384 aa  245  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  39.24 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3437  IS605 family transposase  39.24 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  39.24 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  39.24 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  35.58 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  36.72 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  35.58 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  38.69 
 
 
368 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  35.32 
 
 
383 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  35.58 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>