More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0703 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
368 aa  755    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  78.99 
 
 
376 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  74.54 
 
 
381 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  74.54 
 
 
381 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  74.01 
 
 
381 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  72.33 
 
 
410 aa  541  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  71.23 
 
 
410 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  72.88 
 
 
405 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  70.41 
 
 
405 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  72.33 
 
 
410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  65.66 
 
 
377 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  65.75 
 
 
375 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  61.05 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  64.84 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  60.55 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  59.18 
 
 
391 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  60.5 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  64.56 
 
 
377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  60.44 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  58.36 
 
 
391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  58.79 
 
 
381 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  57.69 
 
 
381 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  57.69 
 
 
408 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  56.56 
 
 
416 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  56.56 
 
 
373 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  64.82 
 
 
326 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  52.62 
 
 
377 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  53.61 
 
 
367 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  53.33 
 
 
367 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  64.83 
 
 
299 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  55.56 
 
 
406 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  52.51 
 
 
424 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  46.79 
 
 
403 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  46.79 
 
 
403 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  46.79 
 
 
403 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  46.79 
 
 
403 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  46.52 
 
 
403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  47.28 
 
 
393 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  45.21 
 
 
362 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  44.96 
 
 
435 aa  308  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  46.47 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  47.03 
 
 
370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  44.96 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  44.04 
 
 
390 aa  299  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  44.04 
 
 
427 aa  299  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  44.41 
 
 
417 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  46.49 
 
 
370 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  44.04 
 
 
392 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  45.16 
 
 
425 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  44.72 
 
 
394 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  43.21 
 
 
450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  42.66 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  42.94 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  41.83 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  41.27 
 
 
373 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  40.97 
 
 
383 aa  276  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  40.72 
 
 
372 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.98 
 
 
405 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  41.85 
 
 
383 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  41.85 
 
 
383 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  41.85 
 
 
383 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  42.98 
 
 
384 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  40.44 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  40.17 
 
 
372 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  39.89 
 
 
373 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  39.89 
 
 
373 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  39.89 
 
 
373 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  43.09 
 
 
399 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
383 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  43.09 
 
 
399 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  40.22 
 
 
373 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  40.17 
 
 
372 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  41.44 
 
 
440 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.34 
 
 
372 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  41.57 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
383 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  40.55 
 
 
404 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  40.55 
 
 
404 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  40.72 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
402 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  39.3 
 
 
370 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
402 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  42.13 
 
 
383 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
402 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  41.76 
 
 
371 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  40.17 
 
 
383 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  38.25 
 
 
362 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  39.02 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  38.75 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  42.82 
 
 
403 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  39.89 
 
 
383 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  39.89 
 
 
383 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  38.75 
 
 
393 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.67 
 
 
370 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  39.68 
 
 
382 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>