More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0717 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0717  transposase  100 
 
 		 219 aa  458  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  97.72 
 
 		 231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  90.87 
 
 		 348 aa  417  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  90.87 
 
 		 348 aa  417  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  92.24 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  61.4 
 
 		 403 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  60.93 
 
 		 403 aa  293  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  60 
 
 		 406 aa  291  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  60 
 
 		 403 aa  288  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  62.91 
 
 		 411 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  61.97 
 
 		 413 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  61.5 
 
 		 411 aa  278  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  60.56 
 
 		 411 aa  277  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  60.28 
 
 		 411 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  60.09 
 
 		 411 aa  275  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  56.42 
 
 		 400 aa  274  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  57.34 
 
 		 402 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  58.26 
 
 		 402 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  58.26 
 
 		 402 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  58.72 
 
 		 387 aa  272  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  58.26 
 
 		 402 aa  272  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  59.17 
 
 		 422 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  58.72 
 
 		 402 aa  269  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  58.26 
 
 		 382 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  58.26 
 
 		 382 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  57.8 
 
 		 402 aa  268  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  58.26 
 
 		 402 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  58.26 
 
 		 402 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  57.8 
 
 		 402 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  57.8 
 
 		 402 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  56.07 
 
 		 402 aa  264  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  56.88 
 
 		 402 aa  261  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  58.49 
 
 		 399 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  55.09 
 
 		 431 aa  252  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.58 
 
 		 435 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  49.55 
 
 		 381 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  49.55 
 
 		 381 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  48.39 
 
 		 408 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  48.39 
 
 		 408 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  46.05 
 
 		 422 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0079  IS605 family transposase OrfB  49.41 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  41.18 
 
 		 397 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  41.18 
 
 		 397 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 		 424 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.1 
 
 		 396 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.58 
 
 		 403 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.06 
 
 		 403 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  36.54 
 
 		 393 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  36.54 
 
 		 393 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.6 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.58 
 
 		 401 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.6 
 
 		 398 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  36.02 
 
 		 373 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  35.1 
 
 		 417 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  36.02 
 
 		 373 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.55 
 
 		 373 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.25 
 
 		 416 aa  134  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 409 aa  134  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  35.55 
 
 		 372 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  35.55 
 
 		 372 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.65 
 
 		 415 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.55 
 
 		 372 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.6 
 
 		 373 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.6 
 
 		 373 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.6 
 
 		 373 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  35.07 
 
 		 373 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.86 
 
 		 361 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.55 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  34.12 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.33 
 
 		 399 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  37.33 
 
 		 399 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  39 
 
 		 393 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.02 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 363 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 363 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 		 363 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 		 363 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  36.32 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  35.32 
 
 		 399 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.15 
 
 		 395 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 363 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.02 
 
 		 370 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 383 aa  121  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  34.84 
 
 		 383 aa  121  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.56 
 
 		 370 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  35.82 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  35.82 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  35.82 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.07 
 
 		 386 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.79 
 
 		 517 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  36.41 
 
 		 399 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  37.07 
 
 		 424 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  34.39 
 
 		 383 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  36.27 
 
 		 399 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 		 390 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  35.32 
 
 		 363 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  35.82 
 
 		 363 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  39.87 
 
 		 332 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 		 377 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4167  transposase IS605 OrfB  35.35 
 
 		 494 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.220651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>