More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2166 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  97.16 
 
 
402 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  97.28 
 
 
382 aa  745    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
387 aa  807    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  95.87 
 
 
402 aa  772    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  97.42 
 
 
402 aa  785    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  97.28 
 
 
382 aa  745    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  82.15 
 
 
402 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  95.87 
 
 
402 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  96.64 
 
 
402 aa  776    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  96.9 
 
 
402 aa  782    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  96.12 
 
 
402 aa  775    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  97.16 
 
 
402 aa  782    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  96.38 
 
 
402 aa  780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  97.93 
 
 
402 aa  793    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  95.87 
 
 
402 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  61.78 
 
 
403 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  62.92 
 
 
400 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  60.63 
 
 
411 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  61.52 
 
 
406 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  60.99 
 
 
403 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  61.26 
 
 
403 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  60.99 
 
 
411 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  60.63 
 
 
411 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  59.84 
 
 
411 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  59.84 
 
 
411 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  59.53 
 
 
413 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  63.96 
 
 
399 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  57.26 
 
 
431 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  58.45 
 
 
348 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  58.45 
 
 
348 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  57.59 
 
 
348 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  56.4 
 
 
422 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.09 
 
 
435 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  45.69 
 
 
381 aa  348  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  45.43 
 
 
381 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  44.3 
 
 
422 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  47.12 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  46.62 
 
 
408 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  57.96 
 
 
231 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  58.72 
 
 
219 aa  272  9e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  39.35 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  39.35 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  39.12 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.92 
 
 
416 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.6 
 
 
391 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.18 
 
 
415 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.2 
 
 
395 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.81 
 
 
396 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.2 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.27 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.6 
 
 
399 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.6 
 
 
399 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.48 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.28 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.29 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  36.01 
 
 
399 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.76 
 
 
373 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.31 
 
 
373 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 
416 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.76 
 
 
373 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.49 
 
 
373 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.76 
 
 
372 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.03 
 
 
368 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  37.08 
 
 
386 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  36.18 
 
 
429 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.46 
 
 
381 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  35.9 
 
 
398 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  35.9 
 
 
398 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.45 
 
 
424 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.78 
 
 
361 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
370 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.49 
 
 
372 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.49 
 
 
372 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.34 
 
 
410 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 
383 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.49 
 
 
372 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.49 
 
 
373 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.49 
 
 
373 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  35.9 
 
 
398 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.49 
 
 
373 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  32.89 
 
 
385 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.47 
 
 
402 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 
383 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.21 
 
 
370 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.28 
 
 
393 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.28 
 
 
393 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  34.19 
 
 
377 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 
383 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.18 
 
 
429 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.16 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.77 
 
 
410 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
391 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.54 
 
 
363 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  32.64 
 
 
409 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.17 
 
 
405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  32.89 
 
 
371 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>