More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1890 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  99.7 
 
 		 398 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  100 
 
 		 335 aa  693    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  96.71 
 
 		 398 aa  673    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  99.7 
 
 		 398 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  94.27 
 
 		 292 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  58.51 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  47.35 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  43.73 
 
 		 442 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  43.73 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  40.12 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  40.9 
 
 		 393 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  40.9 
 
 		 393 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  42.9 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  41.14 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  41.9 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  37.39 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  37.39 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3033  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  39.29 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000443442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  34.86 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  34.86 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  34.86 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  34.86 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  39.6 
 
 		 405 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  39 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 		 383 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  34.25 
 
 		 403 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  38.97 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  33.53 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.04 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  36.18 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  45.45 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.04 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.04 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.44 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  39.7 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  45.45 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.04 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 388 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.09 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  35.43 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  32.44 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  33.14 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  32.74 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  35.63 
 
 		 370 aa  185  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  35.43 
 
 		 402 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  33.13 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  35.43 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  35.43 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.39 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  36.18 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.39 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  38.68 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  35.43 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  32.44 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 411 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  32.44 
 
 		 372 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  35.1 
 
 		 370 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  35.14 
 
 		 402 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  32.25 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  35.24 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.14 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  32.83 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.04 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  34.91 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  32.95 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.14 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  35.33 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  33.9 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  35.14 
 
 		 402 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.43 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.67 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  35.14 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  35.14 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  33.63 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.39 
 
 		 376 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  37.32 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  34.73 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  34.73 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  36.54 
 
 		 422 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  39.48 
 
 		 410 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  38.86 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 413 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  33.62 
 
 		 403 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  38.24 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  35.84 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  33.14 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  32.94 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  34.43 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  34.97 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  34.04 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  34.81 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  32.45 
 
 		 369 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  32.45 
 
 		 369 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  33.05 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  32.45 
 
 		 369 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  32.45 
 
 		 369 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  32.45 
 
 		 369 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>