More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0685 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
442 aa  888    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  79.81 
 
 
461 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  83.71 
 
 
442 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  99.55 
 
 
442 aa  885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  63.85 
 
 
420 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  77.33 
 
 
356 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  77.02 
 
 
356 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  83.67 
 
 
261 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  47.36 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  85.64 
 
 
249 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  64.73 
 
 
267 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  41.84 
 
 
398 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  41.84 
 
 
398 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  40.95 
 
 
398 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  43.48 
 
 
383 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  41.96 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  43 
 
 
399 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  40.48 
 
 
459 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  43.4 
 
 
405 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  41.15 
 
 
460 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  43.73 
 
 
335 aa  245  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  38.08 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  42.31 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  39.81 
 
 
399 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  39.81 
 
 
399 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  39.1 
 
 
405 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  41.96 
 
 
407 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  39.49 
 
 
405 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10940  transposase  40.14 
 
 
550 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  38.97 
 
 
410 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  38.73 
 
 
363 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  83.08 
 
 
192 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  37.37 
 
 
368 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 
393 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  35.71 
 
 
393 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  39.64 
 
 
410 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  32.91 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  32.4 
 
 
370 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.74 
 
 
372 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  32.65 
 
 
370 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  37.53 
 
 
393 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  32.74 
 
 
370 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  32.66 
 
 
370 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  32.65 
 
 
370 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.82 
 
 
395 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  38.3 
 
 
377 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  30.87 
 
 
370 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  38.56 
 
 
377 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  37.28 
 
 
377 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37 
 
 
381 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  31.89 
 
 
393 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  33.08 
 
 
373 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  30.87 
 
 
370 aa  203  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  30.43 
 
 
370 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.01 
 
 
391 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  34.6 
 
 
391 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  32.99 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  34.47 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  33.59 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  30.2 
 
 
370 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  31.1 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.58 
 
 
373 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  77.95 
 
 
134 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  33.83 
 
 
373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  44.49 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.34 
 
 
376 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
383 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  35.37 
 
 
384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  34.28 
 
 
394 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  32.91 
 
 
372 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  32.15 
 
 
372 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  31.99 
 
 
440 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.57 
 
 
390 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  32.15 
 
 
372 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  32.66 
 
 
372 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  31.44 
 
 
383 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 
383 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
391 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 
404 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 
404 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.84 
 
 
381 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
383 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.91 
 
 
403 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
375 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  31.08 
 
 
373 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.91 
 
 
403 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
383 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  31.08 
 
 
373 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.91 
 
 
403 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.91 
 
 
403 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  31.08 
 
 
373 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.38 
 
 
391 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  32.56 
 
 
383 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  31.36 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
403 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  31.22 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  31.22 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>