More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3267 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  99.72 
 
 		 356 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 		 356 aa  705    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  78.88 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  82.35 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  77.33 
 
 		 442 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  77.02 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  77.01 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  56.4 
 
 		 420 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  68.53 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  78.53 
 
 		 249 aa  298  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  46.86 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  45.6 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  85.27 
 
 		 192 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  48.24 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  44.19 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  44.19 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  43.6 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  42.81 
 
 		 409 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  43.55 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  41.01 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  39.35 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  39.35 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  77.44 
 
 		 134 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  44.2 
 
 		 410 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  43.97 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  43.12 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  41.88 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  40.6 
 
 		 368 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  40.74 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  40.07 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  40.07 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  45.45 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  42.03 
 
 		 410 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  41.92 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  45.14 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  41.99 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  35.44 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  41.3 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  35.46 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.05 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  34.56 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.68 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  35.09 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  35.09 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.65 
 
 		 372 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  34.39 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1968  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  56.25 
 
 		 197 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  35.44 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.36 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  35.09 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  34.4 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  34.18 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 		 410 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  41.39 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.14 
 
 		 381 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.67 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.74 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.67 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  42.12 
 
 		 377 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  33.68 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  34.66 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.02 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  32.88 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  33.22 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  40.31 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  39.58 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.02 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  45.38 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  37.23 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.4 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  33 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  33 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  33 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  36.1 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  33 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  37.09 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  41.39 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  32.67 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  33.94 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  33.94 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  33.94 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  33.1 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  38.35 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  33.94 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  33.33 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  33.94 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  37.41 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  33.45 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  33.1 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  33.8 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  32.75 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.92 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  33.33 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>