More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0659 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  100 
 
 
398 aa  825    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  100 
 
 
398 aa  825    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  97.49 
 
 
398 aa  806    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  99.7 
 
 
335 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  94.5 
 
 
292 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  57.87 
 
 
399 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  47.79 
 
 
383 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  43.19 
 
 
409 aa  285  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  42.08 
 
 
442 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  41.84 
 
 
442 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  41.1 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  41.1 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  43.62 
 
 
393 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  41.06 
 
 
461 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  41.65 
 
 
442 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  40.33 
 
 
363 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  41.36 
 
 
405 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  41.08 
 
 
410 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  36.09 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  36.09 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  36.09 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  36.09 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  37.97 
 
 
370 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  37.97 
 
 
370 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  35.54 
 
 
403 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  39.69 
 
 
377 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  40.98 
 
 
405 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.12 
 
 
395 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3033  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.92 
 
 
400 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000443442 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.05 
 
 
373 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  40.78 
 
 
377 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  41.28 
 
 
410 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  40.71 
 
 
368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.32 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.32 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.32 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  40.83 
 
 
377 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 
410 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.58 
 
 
372 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  34.47 
 
 
411 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.05 
 
 
373 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.32 
 
 
372 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  34.55 
 
 
411 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.7 
 
 
373 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  36.76 
 
 
370 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  35.36 
 
 
383 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  34.62 
 
 
393 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  35.36 
 
 
383 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  34.71 
 
 
411 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.21 
 
 
391 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  36.49 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.05 
 
 
372 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  36.91 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.05 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  33.97 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.43 
 
 
373 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.96 
 
 
370 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.49 
 
 
370 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.77 
 
 
403 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  34.95 
 
 
413 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  35.14 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  38.06 
 
 
377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  35.95 
 
 
370 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  35.95 
 
 
393 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  44.19 
 
 
356 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  44.19 
 
 
356 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.04 
 
 
399 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.04 
 
 
399 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  34.3 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  39.18 
 
 
375 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  34.86 
 
 
396 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  36.22 
 
 
393 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  35.68 
 
 
370 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  32.98 
 
 
383 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  35.33 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  36.41 
 
 
384 aa  216  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  33.95 
 
 
388 aa  215  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  35.05 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  35.91 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.73 
 
 
376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.73 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.34 
 
 
383 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  38.13 
 
 
440 aa  212  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.34 
 
 
383 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.59 
 
 
394 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  33.76 
 
 
402 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.97 
 
 
416 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  36.06 
 
 
402 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
405 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
405 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.54 
 
 
381 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.78 
 
 
372 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  36.73 
 
 
402 aa  210  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
391 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  36.15 
 
 
402 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  40.44 
 
 
402 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  33.82 
 
 
411 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  35.59 
 
 
391 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>