More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5114 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 461 aa  934    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  79.81 
 
 		 442 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  79.34 
 
 		 442 aa  693    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  79.81 
 
 		 442 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  60.31 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  82.68 
 
 		 356 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  82.35 
 
 		 356 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  76.73 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  67.35 
 
 		 267 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  90.85 
 
 		 192 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  43.74 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  78.86 
 
 		 249 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  42.79 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  40.77 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  42.01 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  40.22 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  41.06 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  41.06 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  39.86 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  40.09 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  39.63 
 
 		 399 aa  239  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  41.42 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  41.14 
 
 		 335 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  40.31 
 
 		 410 aa  232  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10940  transposase  39.7 
 
 		 550 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  37.23 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  37.94 
 
 		 363 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  37.44 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  37.44 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  35.98 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  35.98 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  37.91 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  37.25 
 
 		 368 aa  213  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  38.78 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  36.73 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  31.06 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  31.9 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  32.57 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  33.95 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  32.41 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  37.18 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  32.41 
 
 		 393 aa  203  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  32.66 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  36.41 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  32.42 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  32.15 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  35.66 
 
 		 384 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  34.63 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.95 
 
 		 372 aa  200  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  81.36 
 
 		 134 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  30.81 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  31.66 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  47.04 
 
 		 293 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  31.23 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 		 292 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  37.82 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  31.65 
 
 		 393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  35.35 
 
 		 377 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  31.67 
 
 		 373 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.18 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.39 
 
 		 381 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.54 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  32.35 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  33.74 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  33.74 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  30.92 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  30.92 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  30.92 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  31.59 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  33.5 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  33.01 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  31.66 
 
 		 372 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  31.16 
 
 		 372 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  31.58 
 
 		 372 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  31.02 
 
 		 372 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  35.87 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  33.5 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.5 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.3 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.3 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.52 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.3 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.3 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  31.39 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  32.22 
 
 		 383 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  33.01 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  32.22 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 		 402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  31.82 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  31.45 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1968  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  66.67 
 
 		 197 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  30.81 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  35.13 
 
 		 304 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  28.43 
 
 		 382 aa  183  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.76 
 
 		 390 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>