More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0613 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  81.51 
 
 		 411 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  78.83 
 
 		 411 aa  687    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  84.99 
 
 		 413 aa  734    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 411 aa  855    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  86.37 
 
 		 411 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  78.1 
 
 		 411 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  65.2 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  58.62 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  61.38 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  61.89 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  62.57 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.15 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  59.12 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  57.91 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  58.05 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  57.32 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  58.64 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  57.8 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  58.05 
 
 		 402 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  59.84 
 
 		 387 aa  484  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  58.05 
 
 		 402 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  58.05 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  57.8 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  57.56 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  57.69 
 
 		 382 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  57.69 
 
 		 382 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  59.3 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  59.3 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  59.3 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  51.86 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  48.45 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  47.18 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  41.77 
 
 		 422 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  44.03 
 
 		 381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  44.03 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  41.97 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  41.67 
 
 		 408 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  41.41 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  59.01 
 
 		 231 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  60.09 
 
 		 219 aa  275  8e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  37.24 
 
 		 397 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  37.24 
 
 		 397 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  35.7 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  34.47 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  34.47 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  34.07 
 
 		 416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  36.31 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  34.72 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.77 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.83 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  34.38 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.07 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  35.77 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.96 
 
 		 373 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.41 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.5 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  35.5 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  35.5 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  35.5 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  35.5 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.5 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.5 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  35.88 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.09 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  34.56 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  36.96 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  33.98 
 
 		 440 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  34.57 
 
 		 363 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  36.96 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  36.96 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  36.96 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.41 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.41 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  32.75 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.85 
 
 		 370 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  36.05 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  37.23 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  34.47 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 383 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 		 383 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 363 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  34.04 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  34.2 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 363 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.38 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  32.98 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  33.69 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  33.17 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.91 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>