More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0401 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0401  transposase  100 
 
 		 402 aa  830    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  39 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  40.44 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  40.44 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  40.44 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  36.18 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  35.92 
 
 		 383 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  35.92 
 
 		 383 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  35.92 
 
 		 383 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  39.7 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  34.88 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  34.54 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  34.54 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.03 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  36.68 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  35.53 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  36.34 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  36.07 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.76 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  36.41 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  36.04 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  35.28 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  35.28 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  35.85 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  36.66 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  36.66 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  36.84 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.78 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  36.57 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  35.15 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  34.25 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  35.73 
 
 		 380 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  33.25 
 
 		 442 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.33 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  34.44 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  36.73 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  35.98 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  36.73 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  36.83 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  33.78 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  33.78 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  33.78 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.85 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  33.78 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  38.51 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3437  IS605 family transposase  33.78 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  37.46 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  33.88 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  33.88 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2896  IS605 family transposase OrfB  34.43 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  32.09 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  33.17 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  36.06 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  33.16 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  32.38 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  43.14 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.98 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2865  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.52 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.931396  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.02 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.7 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  37.67 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  33.08 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  32.32 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  37.54 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  32.32 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  35.31 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  35.31 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.54 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  31.02 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  37.89 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  33.16 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.24 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  38.1 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.61 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2486  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.24 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  37.73 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  33.96 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  32.88 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  41.71 
 
 		 261 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.86 
 
 		 361 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  32.98 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  32.8 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.15 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  32.8 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  34.92 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  32.98 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  32.8 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>