More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2738 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  100 
 
 		 361 aa  754    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  51.45 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  48.08 
 
 		 406 aa  316  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  45.98 
 
 		 399 aa  292  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  43.86 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  44.6 
 
 		 399 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.13 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  46.13 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  43.95 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  43.66 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.44 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.63 
 
 		 399 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  43.95 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  43.9 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  43.66 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  43.36 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  41.97 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  44.73 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  41.64 
 
 		 466 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  43.07 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  39.77 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  41.89 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  40.11 
 
 		 409 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  38.44 
 
 		 395 aa  242  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  44.14 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.48 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  38.51 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  38.95 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  36.89 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.76 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  37.07 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  37.07 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  37.07 
 
 		 363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.69 
 
 		 461 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  37.07 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  37.35 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  37.77 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  37.95 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  36.68 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  37.35 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  37.95 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  37.95 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  37.95 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  38.07 
 
 		 382 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  38.07 
 
 		 382 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  37.22 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  36.56 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  38.07 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  38.07 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  35.23 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  36.65 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  36.31 
 
 		 402 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  36.25 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  37.78 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  37.84 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  36.41 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  36.41 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  35.51 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.05 
 
 		 399 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  36.08 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  37.78 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  37.78 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  36.31 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.08 
 
 		 370 aa  205  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  36.93 
 
 		 402 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  37.5 
 
 		 402 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  36.45 
 
 		 405 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  36.59 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  36.31 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  35.8 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  37.5 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  37.46 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  37.46 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  36.08 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  36.08 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  35.8 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  36.08 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  35.71 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  37.22 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  35.98 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  36.91 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  38.53 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  36.15 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  36.42 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.22 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  35.8 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  36.91 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  34.02 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>