More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0388 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  100 
 
 		 373 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  47.08 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  42.82 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  44.66 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.57 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  45.57 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  43.04 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  42.78 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.91 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.99 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  43.15 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  39.4 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  40.95 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  40.39 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  39.94 
 
 		 380 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  39.12 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  39.55 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  39.83 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.48 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  38.72 
 
 		 466 aa  235  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  38.72 
 
 		 371 aa  235  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  39.74 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  38.72 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  39.41 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  37.6 
 
 		 409 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  32.32 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  32.22 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  32.5 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  32.04 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.51 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  33.7 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  33.42 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  33.24 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  34.32 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  33.51 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  35.04 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.41 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  33.42 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  33.97 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  33.7 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.35 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  33.97 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  32.97 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  33.7 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  32.97 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  32.52 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  33.88 
 
 		 394 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  32.96 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.77 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.62 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  34.03 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  37.57 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  32.61 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  32.97 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0822  putative transposase IS605 family  32.31 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0682059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3231  putative transposase IS605 family  32.31 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  35.11 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.96 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.15 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  36.86 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  31.15 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.24 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  34.88 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.4 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.97 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  31.42 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  30.53 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  34.32 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  32.88 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.42 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.42 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.42 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  34.93 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.42 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0172  putative transposase IS605 family  32.46 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  31.42 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.43 
 
 		 395 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  31.64 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  31.64 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  35.5 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  36.02 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  36.7 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>