More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5918 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  95.24 
 
 		 399 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  85.46 
 
 		 399 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  84.46 
 
 		 399 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 399 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  86.93 
 
 		 406 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  73.43 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  73.43 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.98 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  42.78 
 
 		 373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  41.12 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  39.85 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  40.05 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  40.16 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  40.15 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  66.85 
 
 		 229 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  39.9 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  36.67 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  40.34 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  38.38 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  38.66 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  38.92 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  38.33 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  37.37 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  36.04 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  33.68 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  33.76 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  34.26 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  33.16 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  33.76 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  32.37 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  34.36 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  33.76 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  33.76 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.42 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  36.34 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  33.5 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  33.08 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.33 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  33.76 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  32.84 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  32.84 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.39 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  33.08 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  32.99 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.51 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  34.84 
 
 		 381 aa  186  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  34.84 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  31.7 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  31.62 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  32.83 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.98 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  31.39 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  33.78 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 		 363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  26.5 
 
 		 424 aa  179  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  36.34 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  36.34 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  29.77 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  29.72 
 
 		 363 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  31.54 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  27.43 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  29.59 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  32.03 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  33 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  31.95 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  32.75 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.31 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  28.31 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.83 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.08 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.18 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  34.25 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.17 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  32.7 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  32.7 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  26.17 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.19 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.14 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.26 
 
 		 370 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.19 
 
 		 424 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.19 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4522  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.19 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.839734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  26.05 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.08 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  31.76 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  31.7 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>