More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2680 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2680  transposase  100 
 
 		 229 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  80.57 
 
 		 399 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  80.57 
 
 		 399 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  71.35 
 
 		 399 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  66.85 
 
 		 399 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  69.59 
 
 		 399 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  69.01 
 
 		 406 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  67.84 
 
 		 399 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  45.51 
 
 		 429 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  44.23 
 
 		 429 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  41.76 
 
 		 361 aa  116  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  44.87 
 
 		 424 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  35.67 
 
 		 449 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  43.27 
 
 		 338 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  35.45 
 
 		 405 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  40.59 
 
 		 380 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  36.54 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.93 
 
 		 373 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  37.43 
 
 		 496 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  43.2 
 
 		 380 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  36.65 
 
 		 399 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  41.18 
 
 		 402 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  34.57 
 
 		 386 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  35.26 
 
 		 396 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  34.33 
 
 		 380 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  33.12 
 
 		 424 aa  94.7  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 		 409 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  41.52 
 
 		 380 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  32.34 
 
 		 363 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  40.94 
 
 		 380 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  34.66 
 
 		 376 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  31.84 
 
 		 363 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  34.94 
 
 		 405 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  34.94 
 
 		 405 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  31.84 
 
 		 363 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  43.4 
 
 		 380 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  31.84 
 
 		 363 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.98 
 
 		 363 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  31.84 
 
 		 363 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1224  transposase, IS605 OrfB family  45.63 
 
 		 425 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  38.22 
 
 		 373 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.59 
 
 		 383 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  32.98 
 
 		 363 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  33.01 
 
 		 362 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  33.97 
 
 		 394 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  33.97 
 
 		 394 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4459  transposase, IS605 OrfB family  36.63 
 
 		 398 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  33.82 
 
 		 410 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  39.77 
 
 		 354 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  31.34 
 
 		 363 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  30.19 
 
 		 395 aa  90.9  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.96 
 
 		 383 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  31.34 
 
 		 363 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  35.88 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  32.62 
 
 		 363 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  30.8 
 
 		 396 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  30.8 
 
 		 396 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  30.8 
 
 		 413 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  36.25 
 
 		 371 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  31.52 
 
 		 311 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  32.24 
 
 		 370 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3144  transposase, IS605 OrfB family  38.12 
 
 		 398 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.545249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.46 
 
 		 424 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 390 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  31.06 
 
 		 401 aa  88.2  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.12 
 
 		 395 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  34.71 
 
 		 385 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  34.69 
 
 		 500 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  33.73 
 
 		 381 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  31.76 
 
 		 404 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  29.7 
 
 		 370 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  33.91 
 
 		 377 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  32.03 
 
 		 413 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  31.76 
 
 		 404 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  36.75 
 
 		 385 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  32.03 
 
 		 413 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  33.93 
 
 		 416 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  32.03 
 
 		 413 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  35.26 
 
 		 383 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.59 
 
 		 424 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  31.52 
 
 		 370 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  30.12 
 
 		 370 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  31.93 
 
 		 461 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  32.17 
 
 		 380 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  35.26 
 
 		 383 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1600  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.59 
 
 		 424 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  34.94 
 
 		 406 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  33.55 
 
 		 370 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  38.32 
 
 		 422 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4643  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.59 
 
 		 424 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.59 
 
 		 424 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  30.91 
 
 		 370 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.33 
 
 		 381 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  31.33 
 
 		 393 aa  85.5  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.72 
 
 		 402 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  28.93 
 
 		 369 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  28.93 
 
 		 369 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  28.93 
 
 		 369 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  28.93 
 
 		 369 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  28.93 
 
 		 369 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>