More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2570 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 		 410 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  34.75 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  36.34 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  36.21 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  35.44 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  34.21 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.92 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.45 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  36.45 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.36 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3575  IS605 family transposase OrfB  36.75 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.07 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.99 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.91 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  36.91 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.99 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  32.57 
 
 		 380 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  32.23 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  31.04 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  31.18 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  31.06 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  31.55 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  30.75 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  33.85 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  30.87 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  32.4 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  32.65 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  30.56 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  31.04 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  31.49 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  32.23 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  31.04 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  31.3 
 
 		 410 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  30.36 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  32.06 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  31.81 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  31.81 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  30.26 
 
 		 368 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  30.56 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  31.3 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  31.33 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  29.9 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  31.78 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  30.32 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  30.79 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  28.88 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  29.25 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.1 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  32.64 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  42.74 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  30.28 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  30.02 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  42.74 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  29.64 
 
 		 363 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  30.46 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  28.24 
 
 		 411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  29.18 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  29.85 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  29.64 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  28.79 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  31.55 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  29.34 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  28.96 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  31.85 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  29.23 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  29.12 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  31.9 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  31.85 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  31.3 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.86 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  28.35 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.95 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  30.24 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  27.36 
 
 		 411 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  32.23 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  27.74 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  28.54 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.35 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  33.23 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  30.69 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  28.07 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  27.88 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  27.55 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  28.42 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  28.09 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  29.55 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  27.3 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.78 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.31 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  33.1 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  26.85 
 
 		 373 aa  136  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>