More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2560 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 431 aa  887    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  59.69 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  57.64 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  58.93 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  58.67 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  58.42 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  56.5 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  56.25 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  56.75 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  56.5 
 
 		 402 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  56.25 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  56.25 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  56.25 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  55.75 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  56 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  55.19 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  57.26 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  56.25 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  55.5 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  56.28 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  56.28 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  54.7 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  54.09 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  53.71 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  51.86 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  53.93 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  53.68 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  51.87 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  51.59 
 
 		 348 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  51.59 
 
 		 348 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  49.02 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  45.74 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  44.59 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  44.59 
 
 		 381 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  45.39 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  45.13 
 
 		 408 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  44.87 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.39 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  54.95 
 
 		 231 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  55.09 
 
 		 219 aa  252  7e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.47 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.34 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.3 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.31 
 
 		 396 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  39.11 
 
 		 399 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  39.11 
 
 		 399 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.69 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  34.52 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  34.52 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  35.49 
 
 		 370 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  35.08 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.05 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.48 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.81 
 
 		 403 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  34.46 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.11 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  35.08 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.77 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.39 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.13 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  36.46 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.5 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.5 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.5 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.95 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.06 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  33.58 
 
 		 440 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.41 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.41 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.41 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  33.08 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.25 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  37.3 
 
 		 332 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  30.89 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  30.89 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.13 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  32.75 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  33.75 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  35.18 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  33.07 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  31.77 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  31.77 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  31.77 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  31.77 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  31.77 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  31.58 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  30.33 
 
 		 409 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  33.17 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.64 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.5 
 
 		 403 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  34.04 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>