More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4187 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
422 aa  878    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  57.11 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  56.17 
 
 
402 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  55.89 
 
 
402 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  55.89 
 
 
402 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  55.89 
 
 
402 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  55.89 
 
 
402 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  55.64 
 
 
402 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  55.16 
 
 
402 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  55.64 
 
 
402 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  55.92 
 
 
402 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  55.64 
 
 
402 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  55.64 
 
 
402 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  55.67 
 
 
402 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  56.66 
 
 
382 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  56.66 
 
 
382 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  56.4 
 
 
387 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  52.38 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  51.19 
 
 
413 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  51.11 
 
 
411 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  49.06 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  52.42 
 
 
406 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  53.09 
 
 
403 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  49.63 
 
 
411 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  49.52 
 
 
411 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  51.91 
 
 
403 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  51.91 
 
 
403 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  49.02 
 
 
431 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  48.45 
 
 
411 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.68 
 
 
435 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  52.81 
 
 
348 aa  361  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  52.25 
 
 
348 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  52.25 
 
 
348 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  46.77 
 
 
381 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  46.77 
 
 
381 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  39.76 
 
 
422 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  59.91 
 
 
231 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  43.22 
 
 
408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  42.97 
 
 
408 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  59.17 
 
 
219 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.6 
 
 
396 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  38.42 
 
 
397 aa  223  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  38.42 
 
 
397 aa  223  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.71 
 
 
416 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  36.08 
 
 
415 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.94 
 
 
417 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.77 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.26 
 
 
373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  33.76 
 
 
373 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  33.76 
 
 
373 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.76 
 
 
373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.76 
 
 
373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.76 
 
 
373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  33.33 
 
 
372 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.59 
 
 
372 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  34.42 
 
 
399 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  33.08 
 
 
372 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  33.08 
 
 
372 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.77 
 
 
398 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  34.36 
 
 
399 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36 
 
 
401 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.43 
 
 
396 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  34.06 
 
 
398 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  34.06 
 
 
398 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  35.82 
 
 
332 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  33.76 
 
 
410 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  32.84 
 
 
409 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 
399 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  32.67 
 
 
383 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.55 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  33.5 
 
 
399 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  33.5 
 
 
399 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  33.82 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  31.52 
 
 
410 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  33 
 
 
377 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  33.86 
 
 
363 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.93 
 
 
403 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  33.18 
 
 
424 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.75 
 
 
395 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.68 
 
 
403 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.48 
 
 
370 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.25 
 
 
391 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  32.38 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.25 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  31.93 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.49 
 
 
405 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  34.18 
 
 
377 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.27 
 
 
368 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  31.63 
 
 
378 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.49 
 
 
399 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  32.49 
 
 
399 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  32.78 
 
 
440 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  31.69 
 
 
377 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  31.44 
 
 
383 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  33.25 
 
 
429 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  31.46 
 
 
370 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  32.65 
 
 
393 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  32.65 
 
 
393 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 
461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.63 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>