More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0668 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0668  transposase  100 
 
 		 231 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  97.72 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  93.83 
 
 		 348 aa  443  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  92.51 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  92.51 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  61.88 
 
 		 403 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  61.43 
 
 		 403 aa  308  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.09 
 
 		 406 aa  307  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  60.54 
 
 		 403 aa  303  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  62.16 
 
 		 411 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  61.26 
 
 		 413 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  60.18 
 
 		 411 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  60.27 
 
 		 411 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  60.55 
 
 		 411 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  59.01 
 
 		 411 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  58.26 
 
 		 400 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  56.64 
 
 		 402 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  57.52 
 
 		 402 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  57.52 
 
 		 402 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  57.52 
 
 		 402 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  57.96 
 
 		 387 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  59.91 
 
 		 422 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  57.96 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  56.83 
 
 		 402 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  57.52 
 
 		 382 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  57.52 
 
 		 382 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  57.52 
 
 		 402 aa  277  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  57.52 
 
 		 402 aa  277  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  57.08 
 
 		 402 aa  276  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  55.41 
 
 		 402 aa  275  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  57.08 
 
 		 402 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  56.19 
 
 		 402 aa  271  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  57.27 
 
 		 399 aa  266  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  54.95 
 
 		 431 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.09 
 
 		 435 aa  235  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  50.46 
 
 		 381 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  50.46 
 
 		 381 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  48.87 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  48.87 
 
 		 408 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  46.46 
 
 		 422 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0079  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  38.6 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  38.6 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.89 
 
 		 396 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  39.7 
 
 		 424 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.96 
 
 		 393 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.96 
 
 		 393 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  37.44 
 
 		 373 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  37.44 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.11 
 
 		 373 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.33 
 
 		 403 aa  141  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.78 
 
 		 403 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  35.11 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  37 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  37 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.67 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.67 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  33.91 
 
 		 417 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.67 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  37 
 
 		 372 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  35.78 
 
 		 409 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  34.22 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.11 
 
 		 361 aa  138  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37 
 
 		 372 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.33 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.44 
 
 		 396 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.22 
 
 		 415 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.57 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  35.27 
 
 		 416 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.44 
 
 		 399 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  35.44 
 
 		 399 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.61 
 
 		 370 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.17 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  36.16 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  36.99 
 
 		 393 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  33.48 
 
 		 381 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  36.16 
 
 		 363 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  35.27 
 
 		 363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  34.93 
 
 		 373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  36 
 
 		 383 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.05 
 
 		 395 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  35.27 
 
 		 363 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  35.56 
 
 		 383 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  34.91 
 
 		 416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.81 
 
 		 424 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 		 391 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  35.24 
 
 		 399 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 		 363 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  36.94 
 
 		 363 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.17 
 
 		 405 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  35.11 
 
 		 383 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.67 
 
 		 403 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.61 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  43.03 
 
 		 332 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  33.18 
 
 		 362 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  31.9 
 
 		 410 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  35.22 
 
 		 391 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  34.38 
 
 		 363 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  34.38 
 
 		 363 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  34.76 
 
 		 326 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>